269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0363 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 422 aa  868    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  49.13 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  46.96 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  43.57 
 
 		 414 aa  303  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  42.97 
 
 		 371 aa  297  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  46.09 
 
 		 367 aa  294  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.09 
 
 		 450 aa  287  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.48 
 
 		 455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42 
 
 		 427 aa  272  7e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.13 
 
 		 451 aa  263  6e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.84 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  43.59 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  39.65 
 
 		 482 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.51 
 
 		 388 aa  230  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  39.13 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  39.47 
 
 		 676 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.83 
 
 		 403 aa  220  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.2 
 
 		 442 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  38.27 
 
 		 419 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.94 
 
 		 460 aa  213  5.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  34.66 
 
 		 471 aa  206  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  37.6 
 
 		 875 aa  203  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.04 
 
 		 570 aa  203  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  35.12 
 
 		 2172 aa  196  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  35.79 
 
 		 469 aa  195  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  35.48 
 
 		 461 aa  190  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  38.29 
 
 		 475 aa  189  9e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.91 
 
 		 520 aa  170  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  36.44 
 
 		 488 aa  169  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  32.97 
 
 		 766 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  31.16 
 
 		 748 aa  155  9e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  34.75 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  34.84 
 
 		 585 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  33.02 
 
 		 712 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  33.23 
 
 		 518 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  31.53 
 
 		 1657 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  35.17 
 
 		 841 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  31.65 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  31.13 
 
 		 370 aa  122  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  28.27 
 
 		 561 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  30 
 
 		 972 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  32.68 
 
 		 1029 aa  120  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.38 
 
 		 892 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  31.56 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  38.3 
 
 		 388 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  30.9 
 
 		 395 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  30.45 
 
 		 400 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  30.19 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001471  pQQ-dependent oxidoreductase gdhB family  32.98 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  27.78 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  29.35 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  30.84 
 
 		 406 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  30.13 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  32.91 
 
 		 918 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  30 
 
 		 908 aa  106  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  29.8 
 
 		 999 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  29.8 
 
 		 999 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  29.87 
 
 		 397 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  36.65 
 
 		 392 aa  106  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  29.04 
 
 		 410 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  31.05 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  30.72 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  29.14 
 
 		 999 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  38.78 
 
 		 405 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  34.33 
 
 		 369 aa  103  7e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  34.33 
 
 		 394 aa  103  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05411  glucose dehydrogenase-B  31.45 
 
 		 358 aa  102  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  33.46 
 
 		 389 aa  102  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  35.29 
 
 		 386 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  29.59 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  27.2 
 
 		 386 aa  102  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  30.69 
 
 		 1138 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  28.7 
 
 		 413 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.21 
 
 		 1200 aa  100  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  29.96 
 
 		 1151 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  32.1 
 
 		 394 aa  99  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  28.49 
 
 		 407 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  27.78 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  32.84 
 
 		 357 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.71 
 
 		 945 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  29.22 
 
 		 388 aa  97.8  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  29.59 
 
 		 1142 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  28.62 
 
 		 408 aa  97.1  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  25 
 
 		 430 aa  97.1  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  28.1 
 
 		 375 aa  96.7  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  28.35 
 
 		 363 aa  96.3  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  27.69 
 
 		 391 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  29.26 
 
 		 909 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  32.8 
 
 		 366 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  30.89 
 
 		 360 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  34.41 
 
 		 369 aa  94.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  28.74 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1798  hypothetical protein  42.55 
 
 		 192 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  27.93 
 
 		 428 aa  94  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  35.48 
 
 		 398 aa  94.4  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  28.01 
 
 		 376 aa  94.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  30 
 
 		 729 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  28.19 
 
 		 382 aa  93.6  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.65 
 
 		 809 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  30.22 
 
 		 1182 aa  93.2  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>