More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1694 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2236  TIP49-like protein  86.25 
 
 
450 aa  789    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.385068 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0715  TIP49 domain-containing protein  88.03 
 
 
451 aa  816    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0616  TBP-interacting protein TIP49  87.97 
 
 
450 aa  805    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1694  TIP49-like protein  100 
 
 
451 aa  891    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0904  TIP49-like protein  66.45 
 
 
456 aa  623  1e-177  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175331  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0862  TIP49-like  58.45 
 
 
441 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0596  TBP-interacting protein TIP49  53.06 
 
 
452 aa  450  1e-125  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.739423 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0253  TIP49 domain protein  55.6 
 
 
452 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.632673  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1220  TIP49 domain protein  49.89 
 
 
448 aa  421  1e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.478544  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01971  RuvB-like helicase 1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBV9]  44.86 
 
 
458 aa  367  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000052606  hitchhiker  0.00951448 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00990  RVB1, putative  41.59 
 
 
484 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31398  predicted protein  40.97 
 
 
455 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556143  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37582  RUVB-like protein  42.48 
 
 
459 aa  354  2e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.262753 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43499  predicted protein  41.67 
 
 
462 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06840  conserved hypothetical protein  41.95 
 
 
463 aa  347  2e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.247034  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29898  transcriptional regulator  41.91 
 
 
484 aa  343  4e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.287738  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19568  predicted protein  39.82 
 
 
485 aa  342  9e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.921701  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00327  RuvB-like helicase 2 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGK3]  40.91 
 
 
468 aa  340  2e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50825  predicted protein  37.72 
 
 
451 aa  322  7e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0946  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.39 
 
 
584 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09311  cell division protein FtsH4  39.39 
 
 
584 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.679797  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.15 
 
 
731 aa  52  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10151  cell division protein FtsH4  38.38 
 
 
584 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.745337  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.39 
 
 
731 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10141  cell division protein FtsH4  39 
 
 
584 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  40.91 
 
 
371 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.73 
 
 
732 aa  51.2  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86369  member of the AAA ATPase family of proteins  37.36 
 
 
810 aa  50.4  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.435802 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.18 
 
 
628 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.18 
 
 
628 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.62 
 
 
731 aa  50.1  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.62 
 
 
731 aa  50.1  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0942  FtsH peptidase  42.35 
 
 
630 aa  50.1  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.09 
 
 
800 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.09 
 
 
781 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.09 
 
 
781 aa  49.7  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  39.39 
 
 
371 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.09 
 
 
784 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.35 
 
 
623 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  41.18 
 
 
628 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0660  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.96 
 
 
620 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464509  normal  0.415833 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.58 
 
 
640 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10341  cell division protein FtsH4  58.14 
 
 
575 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194795  hitchhiker  0.000108584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3521  Holliday junction DNA helicase RuvB  43.66 
 
 
347 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.18 
 
 
628 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.711705 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.58 
 
 
640 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.25 
 
 
633 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.45 
 
 
631 aa  48.5  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03691  AAA family ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12560)  34.23 
 
 
803 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1076  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.43 
 
 
701 aa  47.8  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.18 
 
 
632 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0353  peptidase M41, FtsH  58.14 
 
 
575 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.209104  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  44.16 
 
 
628 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  47.17 
 
 
646 aa  47.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.17 
 
 
723 aa  47.8  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0031  cell division cycle protein 48-related protein  46.55 
 
 
448 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1140  ATPase central domain-containing protein  37.68 
 
 
372 aa  47.8  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  42.35 
 
 
616 aa  47.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17401  Holliday junction DNA helicase RuvB  45.16 
 
 
348 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  39.56 
 
 
658 aa  47.4  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1660  ATPase central domain-containing protein  39.39 
 
 
371 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  40 
 
 
637 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1292  Holliday junction DNA helicase RuvB  42.25 
 
 
349 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.84 
 
 
640 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  32.1 
 
 
371 aa  47.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4167  Holliday junction DNA helicase RuvB  43.66 
 
 
360 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165335  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.44 
 
 
662 aa  47.4  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4998  AAA ATPase central domain protein  52.17 
 
 
317 aa  47.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.12 
 
 
759 aa  47.4  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  42.62 
 
 
810 aa  47.4  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3609  Holliday junction DNA helicase RuvB  42.47 
 
 
347 aa  47  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.84 
 
 
638 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  42.47 
 
 
615 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.27 
 
 
738 aa  47  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  42.86 
 
 
633 aa  47  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.1 
 
 
608 aa  47  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.56 
 
 
643 aa  47  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.63 
 
 
651 aa  47  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4397  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.35 
 
 
618 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.74 
 
 
735 aa  47  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  41.56 
 
 
637 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.27 
 
 
769 aa  47  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.35 
 
 
618 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.55 
 
 
760 aa  46.6  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  44.44 
 
 
930 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.51 
 
 
768 aa  47  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1012  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.67 
 
 
616 aa  47  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  41.77 
 
 
637 aa  46.6  0.0009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  41.77 
 
 
637 aa  46.6  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  40.7 
 
 
630 aa  46.6  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0215  vesicle-fusing ATPase  47.17 
 
 
513 aa  46.6  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.1 
 
 
621 aa  46.2  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2733  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.17 
 
 
671 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.622725  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  60.47 
 
 
645 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  41.18 
 
 
621 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0076  membrane protease FtsH catalytic subunit  40.7 
 
 
644 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.597348  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.3 
 
 
636 aa  46.6  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.47 
 
 
639 aa  46.6  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2418  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.84 
 
 
616 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  39.76 
 
 
647 aa  46.6  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>