202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3015 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3015  VacJ family lipoprotein  100 
 
 
256 aa  525  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00574462  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2268  vacJ lipoprotein, putative  40.23 
 
 
276 aa  204  9e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.232246  normal  0.0547217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1395  VacJ family lipoprotein  39.84 
 
 
260 aa  202  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0967319  normal  0.304519 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1390  VacJ family lipoprotein  41.91 
 
 
255 aa  201  7e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2807  VacJ family lipoprotein  42.67 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3197  vacJ lipoprotein, putative  42.67 
 
 
261 aa  199  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1647  VacJ family lipoprotein  42.48 
 
 
282 aa  199  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1466  VacJ family lipoprotein  42.22 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244149  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2547  VacJ family lipoprotein  42.04 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.683006  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2907  VacJ family lipoprotein  41.33 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.10764  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1355  VacJ-like lipoprotein  40.32 
 
 
256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2897  VacJ family lipoprotein  41.78 
 
 
261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00503136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3039  VacJ family lipoprotein  41.33 
 
 
261 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106365  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3037  surface lipoprotein-like protein  45.5 
 
 
321 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1311  VacJ family lipoprotein  40.44 
 
 
261 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.451613  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1378  VacJ family lipoprotein  40.44 
 
 
261 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1371  VacJ family lipoprotein  40.89 
 
 
261 aa  192  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0255661  hitchhiker  0.0000695889 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2272  lipoprotein VacJ precursor  42.11 
 
 
261 aa  188  5.999999999999999e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00759989  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  38.37 
 
 
255 aa  186  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  42.6 
 
 
304 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1636  vacJ lipoprotein  41.2 
 
 
254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000058509  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03126  hypothetical protein  39.56 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002850  surface lipoprotein VacJ  42.33 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1530  vacJ lipoprotein  38.12 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1437  VacJ family lipoprotein  38.08 
 
 
253 aa  152  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.607774  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1336  VacJ family lipoprotein  36.73 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.134881  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3382  VacJ family lipoprotein  35.57 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2826  VacJ family lipoprotein  40.2 
 
 
253 aa  146  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.853708  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  35.87 
 
 
290 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2602  VacJ family lipoprotein  35.84 
 
 
253 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  40.84 
 
 
336 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02272  predicted lipoprotein  35.87 
 
 
251 aa  141  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1307  VacJ family lipoprotein  35.87 
 
 
251 aa  141  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2642  VacJ family lipoprotein  35.87 
 
 
251 aa  141  9e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2505  VacJ family lipoprotein  35.87 
 
 
251 aa  141  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02233  hypothetical protein  35.87 
 
 
251 aa  141  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2497  VacJ family lipoprotein  35.87 
 
 
251 aa  141  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3490  lipoprotein, VacJ family  35.87 
 
 
251 aa  141  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2729  lipoprotein, VacJ family  35.87 
 
 
251 aa  141  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2885  VacJ family lipoprotein  34.27 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.231217 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1311  VacJ family lipoprotein  35.43 
 
 
251 aa  139  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.561225  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2746  lipoprotein, VacJ family  34.98 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0633065  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2635  VacJ family lipoprotein  34.98 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0775878  hitchhiker  0.0000000000141324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2621  lipoprotein, VacJ family  34.98 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447032  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2581  lipoprotein VacJ family  34.98 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.134529  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2532  lipoprotein, VacJ family  34.98 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  33.91 
 
 
277 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1396  lipoprotein VacJ  34.74 
 
 
254 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1505  VacJ family lipoprotein  34.74 
 
 
254 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0216408  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0386  VacJ lipoprotein  34.74 
 
 
254 aa  137  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3707  VacJ family lipoprotein  38.15 
 
 
221 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00967458  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  34.4 
 
 
329 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  37.07 
 
 
330 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1655  VacJ lipoprotein  36.87 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000371202  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  37.07 
 
 
330 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  37.07 
 
 
330 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  37.07 
 
 
327 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  37.07 
 
 
342 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  37.07 
 
 
310 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  37.07 
 
 
324 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  37.63 
 
 
291 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  37.37 
 
 
266 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  33.94 
 
 
334 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  37.77 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  37.77 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  37.04 
 
 
334 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  37.77 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  37.77 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  34.1 
 
 
340 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  33 
 
 
267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  33 
 
 
267 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  38.62 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  33.64 
 
 
338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  35.82 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  36.27 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  36.79 
 
 
234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  33.5 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  29.84 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  35.58 
 
 
295 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  34.93 
 
 
235 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  35.75 
 
 
235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  34.45 
 
 
235 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  34.17 
 
 
233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  32.34 
 
 
249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  33.97 
 
 
235 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  35.75 
 
 
250 aa  125  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  35.75 
 
 
250 aa  125  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  33 
 
 
269 aa  125  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  35.23 
 
 
325 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  33.17 
 
 
233 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  35.58 
 
 
252 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  30.97 
 
 
260 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  34.04 
 
 
267 aa  122  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal 
 
 
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NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  33.8 
 
 
258 aa  122  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  32.56 
 
 
277 aa  122  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  37.06 
 
 
262 aa  122  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0055  VacJ-like lipoprotein  34.87 
 
 
250 aa  122  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  31.28 
 
 
263 aa  122  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  32.31 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  34.72 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
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