More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2953 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 360 aa  738    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4863  RND family efflux transporter MFP subunit  76.39 
 
 		 360 aa  560  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.176323  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5359  efflux transporter, RND family, MFP subunit  77.78 
 
 		 360 aa  555  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.954819  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5179  efflux transporter, RND family, MFP subunit  72.85 
 
 		 361 aa  527  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472624 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4407  RND family efflux transporter MFP subunit  60.66 
 
 		 360 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  59.56 
 
 		 363 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2947  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.98 
 
 		 363 aa  411  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2859  acridine efflux pump  57.7 
 
 		 373 aa  391  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.768203  normal  0.0209077 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0537  HlyD family multidrug resistance protein  50.27 
 
 		 381 aa  374  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.996753  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2230  RND family efflux transporter MFP subunit  50.42 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1728  secretion protein HlyD  49.29 
 
 		 363 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0143164  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0374  secretion protein HlyD  48.34 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0795061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4642  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.06 
 
 		 383 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6592  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.02 
 
 		 378 aa  295  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.25 
 
 		 371 aa  292  5e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.95 
 
 		 520 aa  256  5e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3238  RND family efflux transporter MFP subunit  38.24 
 
 		 368 aa  247  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.86 
 
 		 389 aa  216  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  0.534332 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4132  RND family efflux transporter MFP subunit  33.07 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.41 
 
 		 375 aa  210  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.728308  normal  0.481729 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.46 
 
 		 393 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2259  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.56 
 
 		 397 aa  202  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141283  normal  0.411522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3575  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.35 
 
 		 379 aa  200  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0183852  normal  0.158176 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1117  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.36 
 
 		 376 aa  197  3e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0140148  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1188  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.81 
 
 		 389 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4299  RND family efflux transporter MFP subunit  33.51 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6106  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.42 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0822  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.62 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191782  normal  0.633382 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1564  RND family efflux transporter MFP subunit  37.12 
 
 		 369 aa  189  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000112948  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.89 
 
 		 391 aa  189  9e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000252486  hitchhiker  0.000793327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4802  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.29 
 
 		 398 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012488 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2173  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.87 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1433  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.14 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.195416  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.69 
 
 		 366 aa  182  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.390239  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1204  secretion protein HlyD  32.23 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.377097  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0806  secretion protein HlyD  36.27 
 
 		 371 aa  176  5e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3228  RND family efflux transporter MFP subunit  32.03 
 
 		 378 aa  176  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10068  Secretion protein HlyD  31.71 
 
 		 367 aa  171  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.305445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3019  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.62 
 
 		 378 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.809394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1400  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.1 
 
 		 399 aa  169  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000127527  normal  0.840586 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  33.64 
 
 		 422 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  31.09 
 
 		 371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1930  RND family efflux transporter MFP subunit  31.05 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0761316  hitchhiker  0.00258561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0806  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.22 
 
 		 380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0849  secretion protein HlyD  30.06 
 
 		 441 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  30.79 
 
 		 405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  30.79 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6556  RND family efflux transporter MFP subunit  27.46 
 
 		 399 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  0.769115 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4669  RND family efflux transporter MFP subunit  28.24 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.287204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0295  HlyD family secretion protein  31.11 
 
 		 405 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5537  RND family efflux transporter MFP subunit  30.32 
 
 		 400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3621  secretion protein HlyD  30.32 
 
 		 400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5708  secretion protein HlyD  27.46 
 
 		 429 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4746  RND family efflux transporter MFP subunit  30.32 
 
 		 400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6072  RND family efflux transporter MFP subunit  27.38 
 
 		 399 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.06 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4335  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.06 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  29.92 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  28.74 
 
 		 385 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  30.97 
 
 		 405 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  30.97 
 
 		 405 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  30.97 
 
 		 405 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1004  HlyD family secretion protein  29.45 
 
 		 414 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  28.1 
 
 		 408 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  28.99 
 
 		 414 aa  142  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  28.93 
 
 		 387 aa  142  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0042  secretion protein HlyD  29.62 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0307  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.56 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00481  multidrug resistance protein  28.98 
 
 		 434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3094  putative efflux transporter  31.61 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000031387  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3238  secretion protein HlyD  26.5 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.56 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32243 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1567  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.06 
 
 		 408 aa  139  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.351926 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1112  transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  29.09 
 
 		 438 aa  139  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.680549 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.69 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1466  RND family efflux transporter MFP subunit  29.38 
 
 		 409 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0827  multidrug efflux pump BpeE  29.38 
 
 		 406 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747872  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0416  multidrug efflux pump BpeE  29.38 
 
 		 406 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1840  RND family efflux transporter MFP subunit  29.38 
 
 		 409 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4070  secretion protein HlyD  27.4 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409958  normal  0.154431 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  29.41 
 
 		 427 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2144  multidrug efflux pump BpeE  29.38 
 
 		 406 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3797  RND family efflux transporter MFP subunit  31.85 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.23 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  26.4 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0513  multidrug efflux pump BpeE  29.06 
 
 		 409 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3373  RND family efflux transporter MFP subunit  30.79 
 
 		 405 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  26.3 
 
 		 391 aa  135  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1619  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  29.69 
 
 		 386 aa  135  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0445  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  31.29 
 
 		 408 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000283487 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0849  RND efflux system membrane fusion protein  30 
 
 		 418 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8894  decreased coverage  0.000437743 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  28.88 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1891  RND family efflux transporter MFP subunit  30.35 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.497754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1792  secretion protein HlyD  31.27 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.567297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0385  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  31.29 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4362  RND family efflux transporter MFP subunit  27.92 
 
 		 373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  26.4 
 
 		 396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0906  RND family efflux transporter MFP subunit  28.48 
 
 		 391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2639  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.69 
 
 		 436 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000504  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  30 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>