More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0949 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0949  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 307 aa  621  1e-177  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.949052 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0271  homoserine dehydrogenase  63.58 
 
 		 303 aa  378  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.508007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1842  homoserine dehydrogenase  63.25 
 
 		 303 aa  367  1e-100  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0379  homoserine dehydrogenase  61.29 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.768095 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2003  homoserine dehydrogenase  36.28 
 
 		 317 aa  169  5e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1716  Homoserine dehydrogenase  34.85 
 
 		 314 aa  166  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  34.63 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  35.98 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  35.6 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  31.19 
 
 		 340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  32.34 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  34.67 
 
 		 328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  32.34 
 
 		 337 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  34.64 
 
 		 336 aa  152  8e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  32.05 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  35.05 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  33.86 
 
 		 328 aa  149  8e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  33.73 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  34.25 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0731  homoserine dehydrogenase  33.03 
 
 		 340 aa  143  4e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  34.01 
 
 		 335 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  34.1 
 
 		 355 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  33.82 
 
 		 353 aa  132  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  29.52 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  30.91 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  33.92 
 
 		 353 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  32.41 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  30.43 
 
 		 319 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  31.83 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  31.53 
 
 		 347 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  31.83 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0155  homoserine dehydrogenase  29.43 
 
 		 328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0390  aspartate kinase  33.98 
 
 		 720 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.150199  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0373  aspartate kinase  33.59 
 
 		 739 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  32.35 
 
 		 436 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  28.4 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  29.34 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3931  homoserine dehydrogenase  31.2 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4040  Homoserine dehydrogenase  31.67 
 
 		 350 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2012  homoserine dehydrogenase  32.3 
 
 		 342 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148212  normal  0.080267 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  28.61 
 
 		 359 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  29.06 
 
 		 374 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  31.9 
 
 		 438 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  31.6 
 
 		 441 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  28.57 
 
 		 436 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  28.7 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2400  Homoserine dehydrogenase  32.97 
 
 		 338 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4072  Homoserine dehydrogenase  30.79 
 
 		 350 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1386  Homoserine dehydrogenase  45.24 
 
 		 342 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000335812  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  28.79 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  29.7 
 
 		 418 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  28.48 
 
 		 436 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0844  Homoserine dehydrogenase  28.01 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  31.6 
 
 		 439 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0403  homoserine dehydrogenase  34.47 
 
 		 428 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  31.02 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  32.36 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2057  homoserine dehydrogenase  34.47 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  32.31 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  32.48 
 
 		 432 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0834  homoserine dehydrogenase  34.04 
 
 		 428 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.354577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1957  homoserine dehydrogenase  31 
 
 		 435 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  34.19 
 
 		 428 aa  99.8  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  30.5 
 
 		 431 aa  99.4  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  31.2 
 
 		 428 aa  99.8  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1361  Homoserine dehydrogenase  33.91 
 
 		 339 aa  99.4  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.294507  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  35.4 
 
 		 441 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  32.62 
 
 		 429 aa  99.4  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  32.19 
 
 		 431 aa  99  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  32.41 
 
 		 431 aa  99  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0280  Homoserine dehydrogenase  34.93 
 
 		 427 aa  98.6  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  34.35 
 
 		 440 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  32.91 
 
 		 440 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1559  homoserine dehydrogenase  30.72 
 
 		 353 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  31.33 
 
 		 431 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3678  homoserine dehydrogenase  32.61 
 
 		 438 aa  98.2  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1275  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.99 
 
 		 820 aa  98.2  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  33.48 
 
 		 441 aa  97.4  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  34.96 
 
 		 441 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4165  homoserine dehydrogenase  29.41 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.250616 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  34.47 
 
 		 441 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  32.05 
 
 		 431 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  30.68 
 
 		 431 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0704  homoserine dehydrogenase  33.19 
 
 		 435 aa  97.4  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  30.68 
 
 		 431 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  32.05 
 
 		 431 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2465  Homoserine dehydrogenase  31.3 
 
 		 439 aa  96.7  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202426  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1214  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.27 
 
 		 816 aa  97.1  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  32.05 
 
 		 431 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01680  homoserine dehydrogenase  35.71 
 
 		 429 aa  96.7  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  hitchhiker  0.0000000000000909151 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  31.67 
 
 		 431 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  33.19 
 
 		 417 aa  96.3  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09870  homoserine dehydrogenase  31.16 
 
 		 436 aa  96.7  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.469358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  33.19 
 
 		 417 aa  96.3  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  33.05 
 
 		 431 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1481  homoserine dehydrogenase  30.7 
 
 		 431 aa  96.3  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  29.29 
 
 		 431 aa  96.3  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  32.34 
 
 		 424 aa  95.9  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  33.19 
 
 		 431 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  30.49 
 
 		 438 aa  95.9  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>