More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0116 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  100 
 
 
171 aa  349  1e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  59.65 
 
 
178 aa  227  7e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  62.57 
 
 
181 aa  226  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  56.14 
 
 
178 aa  203  9e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  37.43 
 
 
170 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  36.21 
 
 
178 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  36.84 
 
 
176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  33.92 
 
 
163 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  34.29 
 
 
178 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  33.52 
 
 
168 aa  97.4  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  32 
 
 
194 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  35.8 
 
 
183 aa  95.5  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  32.93 
 
 
179 aa  95.1  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  34.88 
 
 
176 aa  95.1  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  32 
 
 
194 aa  95.1  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  32.35 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  32.95 
 
 
172 aa  91.7  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  30.68 
 
 
176 aa  89  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  33.55 
 
 
170 aa  87  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  30 
 
 
176 aa  86.7  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  33.15 
 
 
190 aa  84.7  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  32.16 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  32.77 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  34.52 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  29.31 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  28.32 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  31.87 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  29.21 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.19 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  32.48 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  28.99 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  32.24 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  30.77 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  27.72 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  32.14 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  30.59 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  31.64 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1872  nitroreductase  28.87 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  28.74 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  31.21 
 
 
181 aa  70.9  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  30 
 
 
184 aa  70.9  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.65 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  28.48 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  32.79 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  32.79 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  30.49 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  31.58 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  27.03 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.29 
 
 
330 aa  68.9  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  30.36 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  27.81 
 
 
321 aa  68.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  27.52 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  28.14 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.65 
 
 
184 aa  67  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1518  nitroreductase  29.11 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  hitchhiker  0.00282354 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  33.59 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  30.12 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  28.11 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  28.95 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  30.32 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  32.34 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  27.04 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  29.52 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  26.74 
 
 
170 aa  63.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  26.4 
 
 
221 aa  63.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  25.37 
 
 
223 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  26.22 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2528  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.67 
 
 
253 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  32.77 
 
 
169 aa  62.8  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.71 
 
 
222 aa  63.2  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0141  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.59 
 
 
324 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  26.94 
 
 
223 aa  63.2  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  27.61 
 
 
173 aa  63.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  29.91 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2217  nitroreductase  31.45 
 
 
192 aa  62.4  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  29.71 
 
 
173 aa  62.8  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0375  nitroreductase  31.82 
 
 
196 aa  62  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0028718  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  32.12 
 
 
169 aa  61.2  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  27.54 
 
 
169 aa  61.2  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3177  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.19 
 
 
253 aa  61.2  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  28.75 
 
 
174 aa  61.2  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  32.28 
 
 
169 aa  61.2  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1805  nitroreductase  24.88 
 
 
199 aa  61.2  0.000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000108045  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  30 
 
 
175 aa  60.8  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  26.77 
 
 
201 aa  60.8  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  27.78 
 
 
206 aa  60.8  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.01 
 
 
227 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1116  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.43 
 
 
214 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0676  nitroreductase  32.91 
 
 
192 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0455  nitroreductase family protein  32.08 
 
 
197 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  30.11 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0247  nitroreductase  24.88 
 
 
206 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  28.74 
 
 
180 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  29.8 
 
 
171 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  29.71 
 
 
215 aa  59.7  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  31.61 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  56.6 
 
 
245 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1270  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.33 
 
 
216 aa  58.9  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  40.96 
 
 
252 aa  59.3  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0603  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.25 
 
 
210 aa  58.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>