217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5115 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5115  putative porin  100 
 
 		 478 aa  983    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58410  putative porin  96.65 
 
 		 484 aa  932    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4560  outer membrane porin, OprD family  49.37 
 
 		 459 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4237  outer membrane porin  48.33 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4295  outer membrane porin  48.88 
 
 		 459 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0341226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0814  outer membrane porin  48.48 
 
 		 471 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657196  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0883  outer membrane porin  46.28 
 
 		 459 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0922  outer membrane porin  46.71 
 
 		 459 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0926  outer membrane porin  47.95 
 
 		 459 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2005  outer membrane porin  40.09 
 
 		 447 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  38.41 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0752  outer membrane porin for cationic amino acids and peptides  35.9 
 
 		 499 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  38.9 
 
 		 448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  39.37 
 
 		 443 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4433  outer membrane porin  35.42 
 
 		 529 aa  250  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.326641 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3268  outer membrane porin  37.37 
 
 		 479 aa  249  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal  0.0282979 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0120  outer membrane porin  33.83 
 
 		 474 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00350083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4861  outer membrane porin  37.37 
 
 		 478 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.054091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5408  outer membrane porin  37.76 
 
 		 490 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  37.7 
 
 		 445 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4500  outer membrane porin  35.32 
 
 		 505 aa  246  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697186  normal  0.197989 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4735  outer membrane porin  37.11 
 
 		 478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5323  outer membrane porin  37.11 
 
 		 478 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5537  outer membrane porin  37.11 
 
 		 478 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00176042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  38.46 
 
 		 441 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0356  OprD family outer membrane porin  35.14 
 
 		 480 aa  239  8e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3014  OprD family outer membrane porin  35.14 
 
 		 527 aa  239  8e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0532717  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2898  OprD family outer membrane porin  35.14 
 
 		 527 aa  239  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.907391  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0390  OprD family outer membrane porin  35.14 
 
 		 527 aa  239  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1248  OprD family outer membrane porin  35.14 
 
 		 486 aa  239  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  37.56 
 
 		 445 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1539  OprD family outer membrane porin  35.14 
 
 		 486 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.993831  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1729  OprD family outer membrane porin  35.14 
 
 		 486 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2214  OprD family outer membrane porin  34.91 
 
 		 501 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  36.26 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  34.76 
 
 		 479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  34.76 
 
 		 449 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  34.73 
 
 		 440 aa  229  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  34.14 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  34.14 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  34.14 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  34.14 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  35.71 
 
 		 447 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  33.04 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  32.94 
 
 		 441 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  33.8 
 
 		 441 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  33.18 
 
 		 446 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40060  OprD family outer membrane porin  33.48 
 
 		 454 aa  213  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  34.58 
 
 		 441 aa  213  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  33.26 
 
 		 444 aa  211  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  32.91 
 
 		 444 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  33.55 
 
 		 444 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  33.64 
 
 		 438 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40000  OprD family outer membrane porin  34.35 
 
 		 452 aa  208  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0644019  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  33.33 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  33.95 
 
 		 448 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  33.56 
 
 		 444 aa  206  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  33.86 
 
 		 447 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  33.56 
 
 		 444 aa  203  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  32.88 
 
 		 447 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  32.65 
 
 		 447 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  31.62 
 
 		 444 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  33.26 
 
 		 431 aa  196  9e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  33.33 
 
 		 420 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  33.03 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  33.41 
 
 		 420 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  31.99 
 
 		 413 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  32.56 
 
 		 468 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5250  porin, putative  33.17 
 
 		 420 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29220  putative porin  34.95 
 
 		 435 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.655739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3977  putative porin  34.26 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02370  putative porin  32.1 
 
 		 452 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000471352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0268  putative porin  32.27 
 
 		 452 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0064  outer membrane porin  33.03 
 
 		 418 aa  182  9.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0645144  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  31.34 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  32.46 
 
 		 418 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  32.13 
 
 		 417 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  32.24 
 
 		 418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3212  outer membrane porin  33.03 
 
 		 414 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  32.81 
 
 		 418 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2476  outer membrane protein  31.98 
 
 		 425 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  34.38 
 
 		 427 aa  170  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  31.99 
 
 		 419 aa  170  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  30.46 
 
 		 418 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  34.09 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  30.65 
 
 		 424 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  31.89 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28400  outer membrane OprD family porin  31.76 
 
 		 425 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00818285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  31.79 
 
 		 416 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  32.21 
 
 		 412 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  30.74 
 
 		 421 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  31.24 
 
 		 417 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  31.29 
 
 		 421 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  31.84 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11340  outer membrane porin  29.57 
 
 		 428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  31.29 
 
 		 421 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  29.64 
 
 		 417 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  31.79 
 
 		 422 aa  165  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0295  outer membrane porin  31.99 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.258921  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  31.84 
 
 		 412 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>