102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_49064 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_57505  urea transport protein  63.18 
 
 
668 aa  862    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20443  normal  0.667471 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49064  urea transport protein  100 
 
 
679 aa  1368    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.427526  normal  0.0261396 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29213  urea transport protein  82.03 
 
 
668 aa  1119    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0581449 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07557  conserved hypothetical protein  42.79 
 
 
692 aa  586  1e-166  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314115  hitchhiker  0.00246133 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02598  urea active transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17570)  41.25 
 
 
680 aa  541  9.999999999999999e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.811341 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07373  solute symporter family transporter (AFU_orthologue; AFUA_6G03200)  34.02 
 
 
699 aa  393  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52351  urea active transport protein  36.56 
 
 
724 aa  393  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0516586  normal  0.828998 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00418  urea transporter (Dur3), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04870)  34.51 
 
 
693 aa  363  4e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_006686  CND00530  urea transporter, putative  31.33 
 
 
674 aa  347  6e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119678  predicted protein  29.39 
 
 
709 aa  317  6e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55023  urea permease  30.34 
 
 
659 aa  301  3e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410596  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20424  urea transporter  30.17 
 
 
704 aa  296  7e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32520  Urea active transport protein  30.87 
 
 
658 aa  290  7e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_768  predicted protein  30.47 
 
 
643 aa  285  1.0000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530084  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30460  Na+/proline symporter  23.65 
 
 
554 aa  90.1  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0720305  normal  0.147602 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01880  Na+/proline symporter  23.2 
 
 
587 aa  88.2  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1604  Na+/solute symporter  25.27 
 
 
556 aa  84  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0772243 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2263  sodium/solute transporter family urea transporter  20.24 
 
 
474 aa  76.6  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0248  Na+/solute symporter  21.92 
 
 
500 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  22.27 
 
 
478 aa  77  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  23.79 
 
 
596 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  21.87 
 
 
476 aa  70.5  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0686  Na+/solute symporter  24.84 
 
 
507 aa  70.1  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.663287  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0779  Na+/solute symporter  20.95 
 
 
482 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  23.87 
 
 
474 aa  68.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  21.26 
 
 
472 aa  66.6  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0029  Na+/solute symporter  21.41 
 
 
488 aa  64.3  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.080483 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  23.55 
 
 
556 aa  63.9  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.31 
 
 
593 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  25.78 
 
 
527 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  22.79 
 
 
482 aa  62  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  23.75 
 
 
483 aa  60.1  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  23.78 
 
 
527 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  25.47 
 
 
530 aa  59.7  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  22.51 
 
 
539 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  23.74 
 
 
529 aa  57.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  20.85 
 
 
562 aa  57.4  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  22.22 
 
 
564 aa  57  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  22.52 
 
 
461 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  25.12 
 
 
490 aa  55.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.88 
 
 
522 aa  55.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  22.38 
 
 
639 aa  54.7  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  21.4 
 
 
638 aa  54.3  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  21.04 
 
 
537 aa  53.9  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  26.36 
 
 
506 aa  53.5  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  21.88 
 
 
483 aa  53.9  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  24 
 
 
597 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  21.84 
 
 
482 aa  53.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  22.08 
 
 
592 aa  52.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  23.19 
 
 
476 aa  51.6  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  23.28 
 
 
577 aa  51.6  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  25.89 
 
 
588 aa  51.2  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  20.25 
 
 
569 aa  51.2  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  20.82 
 
 
565 aa  50.8  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1786  Na+/solute symporter  24.59 
 
 
483 aa  50.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483787  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  27.03 
 
 
482 aa  50.4  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0273  sodium/proline symporter  23.58 
 
 
504 aa  49.3  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  26.5 
 
 
488 aa  49.7  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  24.66 
 
 
520 aa  49.3  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  22.11 
 
 
599 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  23.45 
 
 
500 aa  48.5  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.06 
 
 
561 aa  48.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  30.77 
 
 
568 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  21.4 
 
 
479 aa  47.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  24.79 
 
 
483 aa  47.4  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  22.57 
 
 
461 aa  47.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  23.32 
 
 
587 aa  47  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  28.7 
 
 
483 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  28.7 
 
 
483 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  28.7 
 
 
483 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  28.89 
 
 
493 aa  45.8  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  29.63 
 
 
497 aa  46.6  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  23.78 
 
 
487 aa  46.2  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  21.61 
 
 
541 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  26.74 
 
 
562 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  21.68 
 
 
575 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  21.23 
 
 
633 aa  45.8  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  27.31 
 
 
482 aa  45.8  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  31.25 
 
 
483 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  31.25 
 
 
483 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  31.25 
 
 
483 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  34.44 
 
 
587 aa  45.8  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  31.25 
 
 
483 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  25 
 
 
483 aa  45.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.13 
 
 
489 aa  45.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  35.85 
 
 
483 aa  45.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.99 
 
 
523 aa  45.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  22.55 
 
 
545 aa  45.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  19.78 
 
 
567 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  26.72 
 
 
484 aa  45.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  26.38 
 
 
497 aa  45.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.61 
 
 
541 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  20.93 
 
 
542 aa  44.7  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  27.2 
 
 
529 aa  44.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  34.09 
 
 
549 aa  44.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  22.37 
 
 
544 aa  44.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  25.11 
 
 
495 aa  44.3  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  25 
 
 
513 aa  44.3  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2072  Na+/solute symporter  23.89 
 
 
609 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0164847 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  21.61 
 
 
541 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>