130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49529 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_49529  predicted protein  100 
 
 		 846 aa  1759    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.135063  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00570  transcription factor, putative  28.92 
 
 		 550 aa  208  4e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414146  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42874  predicted protein  34.04 
 
 		 572 aa  168  5e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0187431  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02214  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07060)  26.75 
 
 		 596 aa  165  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0454631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  23.76 
 
 		 1714 aa  68.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.6 
 
 		 1684 aa  68.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  24.62 
 
 		 1196 aa  67.8  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.91 
 
 		 1609 aa  66.6  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.65 
 
 		 1557 aa  66.6  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  23.25 
 
 		 1831 aa  65.1  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  27.37 
 
 		 1858 aa  65.1  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  26.37 
 
 		 742 aa  63.5  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.71 
 
 		 1163 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  25.81 
 
 		 1364 aa  63.5  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  22.63 
 
 		 1367 aa  63.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  25.93 
 
 		 1477 aa  63.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.08 
 
 		 1240 aa  62.4  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28 
 
 		 1267 aa  62  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  25.35 
 
 		 1766 aa  62  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.23 
 
 		 740 aa  60.8  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  22.42 
 
 		 1552 aa  60.8  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  21.55 
 
 		 1789 aa  60.8  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.71 
 
 		 1711 aa  60.1  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.14 
 
 		 1474 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  25.33 
 
 		 1190 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25 
 
 		 1623 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  24.18 
 
 		 1399 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25.82 
 
 		 1161 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.81 
 
 		 943 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50593  predicted protein  31.11 
 
 		 617 aa  59.3  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.594901  normal  0.592668 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  25.82 
 
 		 1161 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  24.58 
 
 		 1211 aa  57.8  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 1221 aa  58.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  28.09 
 
 		 1363 aa  58.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  26.11 
 
 		 1214 aa  57.4  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.84 
 
 		 1072 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  22.86 
 
 		 1016 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  22.86 
 
 		 1016 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  35.2 
 
 		 1334 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  24.46 
 
 		 696 aa  57  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  28.9 
 
 		 1177 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  26.47 
 
 		 1454 aa  56.6  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.84 
 
 		 1072 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.18 
 
 		 919 aa  55.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  23.28 
 
 		 1599 aa  55.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.89 
 
 		 1599 aa  55.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  22.76 
 
 		 1164 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.25 
 
 		 1598 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.36 
 
 		 1076 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  29.77 
 
 		 1236 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  21.93 
 
 		 1656 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  29.35 
 
 		 1217 aa  54.3  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.43 
 
 		 1686 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  24.65 
 
 		 1176 aa  53.5  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  23.13 
 
 		 1100 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.53 
 
 		 924 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  21.98 
 
 		 402 aa  53.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  20.96 
 
 		 1193 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  24.45 
 
 		 1661 aa  52.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  19.86 
 
 		 1760 aa  52.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.5 
 
 		 865 aa  52.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  28.26 
 
 		 618 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.79 
 
 		 1583 aa  52.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  23.44 
 
 		 947 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24 
 
 		 636 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_006686  CND05530  RNA processing-related protein, putative  28.19 
 
 		 511 aa  52  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104569  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  27.27 
 
 		 1188 aa  52  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  23.64 
 
 		 335 aa  51.6  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1670  WD-40 repeat protein  23.38 
 
 		 520 aa  51.6  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1643  WD-40 repeat protein  23.38 
 
 		 520 aa  51.6  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.1 
 
 		 1652 aa  51.2  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.73 
 
 		 1607 aa  51.2  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.29 
 
 		 676 aa  50.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  23.32 
 
 		 1373 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  24.3 
 
 		 1411 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63551  predicted protein  31.25 
 
 		 522 aa  50.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  22.81 
 
 		 1262 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  26.43 
 
 		 1152 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  25.27 
 
 		 1348 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  23.28 
 
 		 1190 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.95 
 
 		 1547 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  24.28 
 
 		 1807 aa  49.3  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  25.91 
 
 		 1523 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21983  predicted protein  28.37 
 
 		 484 aa  49.3  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.383606  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  23.47 
 
 		 1264 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  24.06 
 
 		 1213 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  23.47 
 
 		 1264 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.55 
 
 		 692 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37533  predicted protein  22.9 
 
 		 485 aa  48.9  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  20.92 
 
 		 630 aa  48.5  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28024  predicted protein  25.28 
 
 		 373 aa  48.1  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.641844 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  26.55 
 
 		 405 aa  48.5  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62019  member of Set1p complex, histone methyl transferase  23.99 
 
 		 367 aa  48.1  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.805326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  27.43 
 
 		 1330 aa  48.1  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.92 
 
 		 596 aa  47.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01468  pre-mRNA splicing factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04590)  24.14 
 
 		 521 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.559626  hitchhiker  0.00529797 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  22.63 
 
 		 565 aa  47.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  25.75 
 
 		 1416 aa  47  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  23.61 
 
 		 1491 aa  47.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  28.7 
 
 		 1209 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>