More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2514 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3592  chromosome partitioning ATPase  99.86 
 
 		 735 aa  1457    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.857292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2514  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 735 aa  1461    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2908  lipopolysaccharide biosynthesis  44.05 
 
 		 727 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000198552 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0828  lipopolysaccharide biosynthesis protein  43.45 
 
 		 726 aa  520  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.490846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2688  lipopolysaccharide biosynthesis  40.95 
 
 		 731 aa  468  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.4 
 
 		 720 aa  179  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  27 
 
 		 727 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  27.06 
 
 		 736 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  26.89 
 
 		 722 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  27.38 
 
 		 742 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  25.74 
 
 		 750 aa  137  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  26.72 
 
 		 763 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  25.14 
 
 		 734 aa  125  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  24.42 
 
 		 753 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 		 804 aa  123  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3415  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 		 751 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2701  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 751 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.431033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  23.59 
 
 		 721 aa  112  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  24.44 
 
 		 741 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  27.67 
 
 		 464 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 		 778 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  27.96 
 
 		 624 aa  104  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  21.51 
 
 		 790 aa  100  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13861  hypothetical protein  27.97 
 
 		 780 aa  98.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.832923  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  23.54 
 
 		 753 aa  97.8  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0240  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.87 
 
 		 760 aa  97.8  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0345486 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  24.53 
 
 		 803 aa  97.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 		 730 aa  96.3  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  23.43 
 
 		 741 aa  95.1  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  31.51 
 
 		 524 aa  95.1  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3125  capsular exopolysaccharide family protein  21.96 
 
 		 743 aa  94.7  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.858566  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  27.59 
 
 		 505 aa  94.7  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  25.96 
 
 		 711 aa  93.6  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  26.4 
 
 		 790 aa  93.2  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.85 
 
 		 739 aa  92.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  27.12 
 
 		 778 aa  92.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  23.84 
 
 		 770 aa  92  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  23.86 
 
 		 772 aa  91.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  33.91 
 
 		 605 aa  91.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  22.82 
 
 		 806 aa  90.9  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  23.98 
 
 		 796 aa  90.1  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  37.04 
 
 		 463 aa  89  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  27.2 
 
 		 466 aa  89  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.14 
 
 		 736 aa  89  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  27.02 
 
 		 508 aa  89  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5359  protein-tyrosine kinase  33.87 
 
 		 800 aa  88.6  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2661  hypothetical protein  22.26 
 
 		 684 aa  88.6  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  24.54 
 
 		 803 aa  88.2  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  29.67 
 
 		 496 aa  87  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  23.24 
 
 		 779 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.1 
 
 		 720 aa  86.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  22.76 
 
 		 708 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  24.75 
 
 		 726 aa  85.1  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 737 aa  84.7  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.21 
 
 		 722 aa  84.7  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  28.92 
 
 		 529 aa  84.3  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.78 
 
 		 731 aa  84.3  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1925  protein-tyrosine kinase  26.28 
 
 		 801 aa  84.3  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864288  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3362  capsular exopolysaccharide family  25.11 
 
 		 753 aa  84  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  32.37 
 
 		 743 aa  84  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.56 
 
 		 474 aa  84  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  25 
 
 		 795 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  27.38 
 
 		 778 aa  84  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  22.39 
 
 		 775 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.02 
 
 		 217 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  29.02 
 
 		 217 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  27.2 
 
 		 789 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  24.96 
 
 		 772 aa  82  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  28.39 
 
 		 788 aa  82  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  25.06 
 
 		 739 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  28.33 
 
 		 667 aa  81.6  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0342  protein-tyrosine kinase  26.6 
 
 		 554 aa  82  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0461311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  27.31 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  29.57 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2447  capsular exopolysaccharide family  32.64 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.13568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  27.39 
 
 		 490 aa  81.3  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  27.31 
 
 		 497 aa  81.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.54 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0244  protein-tyrosine kinase  32.62 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  32.86 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  29.82 
 
 		 503 aa  80.9  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.12 
 
 		 575 aa  80.5  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  27.02 
 
 		 521 aa  80.5  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22230  Non-specific protein-tyrosine kinase  32.29 
 
 		 217 aa  80.5  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  33.16 
 
 		 240 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  29.61 
 
 		 766 aa  80.1  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.22 
 
 		 780 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  25.91 
 
 		 474 aa  79.7  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  30.98 
 
 		 539 aa  79.7  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  23.26 
 
 		 815 aa  80.1  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  30.64 
 
 		 252 aa  79  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  25.23 
 
 		 739 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  25.23 
 
 		 739 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  29.18 
 
 		 484 aa  78.6  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  25.23 
 
 		 739 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  29.51 
 
 		 802 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1172  cpsD protein  25.13 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.748604  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  25.72 
 
 		 492 aa  77.4  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  23.66 
 
 		 755 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  23.29 
 
 		 734 aa  76.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>