More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4851 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  100 
 
 		 294 aa  608  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5625  integrase family protein  52.35 
 
 		 273 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  51.26 
 
 		 273 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  43.43 
 
 		 289 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5760  integrase family protein  40.65 
 
 		 291 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3096  tyrosine recombinase XerD subunit  31.53 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00033868  normal  0.385268 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  30.6 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  32.96 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  31.11 
 
 		 290 aa  129  8.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  32.48 
 
 		 282 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  33.2 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  31.43 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0430  site-specific recombinase XerD-like  29.72 
 
 		 291 aa  119  6e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00678047  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  29.89 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  28.21 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  32.58 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  30.11 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  29.29 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  29.7 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  29.75 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  29.29 
 
 		 300 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  30.2 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  29.29 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  30.08 
 
 		 295 aa  116  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  28.68 
 
 		 309 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  30.83 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  32.84 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.06 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  29.25 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  30.98 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.24 
 
 		 302 aa  113  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  39.11 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  29.48 
 
 		 297 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 309 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.28 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  31.32 
 
 		 297 aa  112  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  28.41 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  29.39 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  28.42 
 
 		 324 aa  112  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  27.78 
 
 		 299 aa  112  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 309 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  33.19 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  27.94 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.63 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  27.94 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  30.29 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  30.07 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  29.89 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  28.06 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3027  phage integrase family protein  29.59 
 
 		 343 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.64 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.63 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  31.49 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  28 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.54 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.49 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.54 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  34.09 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  30.73 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  28.29 
 
 		 292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.57 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.58 
 
 		 314 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.86 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.74 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.66 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.182372  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.6 
 
 		 298 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  29.97 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  31.11 
 
 		 310 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  31.22 
 
 		 302 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.06 
 
 		 317 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.39 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.39 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.1 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  28.72 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.39 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.39 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  36.61 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  30.48 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4164  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.49 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.39 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  27.51 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.46 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.46 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  30.32 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  29.02 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  29.29 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.29 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  26.91 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1488  tyrosine recombinase XerD  34.72 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  29.96 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  31.05 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  31.6 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  28.25 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  30.07 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  27.81 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  35.24 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  29.1 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  29.06 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>