More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3729 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3729  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 306 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0223  tRNA pseudouridine synthase A  74.16 
 
 		 293 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00472694  normal  0.027676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0226  tRNA pseudouridine synthase A  74.16 
 
 		 293 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0717  tRNA pseudouridine synthase A  69.82 
 
 		 282 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000371927  normal  0.874871 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2585  tRNA pseudouridine synthase A  70.34 
 
 		 275 aa  398  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1318  tRNA pseudouridine synthase A  68.42 
 
 		 282 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620089  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2986  tRNA pseudouridine synthase A  68.56 
 
 		 272 aa  392  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2207  tRNA pseudouridine synthase A  58.04 
 
 		 294 aa  342  4e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23281  tRNA pseudouridine synthase A  51.53 
 
 		 295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0351  tRNA pseudouridine synthase A  50 
 
 		 293 aa  261  8e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.89141 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16531  tRNA pseudouridine synthase A  50 
 
 		 289 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0673067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19791  tRNA pseudouridine synthase A  49.45 
 
 		 276 aa  252  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1104  tRNA pseudouridine synthase A  49.45 
 
 		 276 aa  252  7e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.723318  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1980  tRNA pseudouridine synthase A  51.15 
 
 		 300 aa  245  8e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0478647  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1626  tRNA pseudouridine synthase A  45.04 
 
 		 268 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.895885  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17411  tRNA pseudouridine synthase A  44.27 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17151  tRNA pseudouridine synthase A  44.66 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.137278  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17251  tRNA pseudouridine synthase A  43.89 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  42.15 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  39.18 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  39.75 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1395  tRNA pseudouridine synthase A  37.5 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  37.96 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  40.08 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1486  tRNA pseudouridine synthase A  36.36 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0039876  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  36.64 
 
 		 261 aa  170  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1055  tRNA pseudouridine synthase A  39.59 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.859222  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1258  tRNA pseudouridine synthase A  39.18 
 
 		 269 aa  169  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0956  tRNA pseudouridine synthase A  39.59 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0850507  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1604  tRNA pseudouridine synthase A  35.93 
 
 		 263 aa  169  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0801  tRNA pseudouridine synthase A  36.08 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0247033  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2867  tRNA pseudouridine synthase A  37.96 
 
 		 270 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.42429 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  36.78 
 
 		 244 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2681  tRNA pseudouridine synthase A  39.18 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0556679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  35.51 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  36.78 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1075  tRNA pseudouridine synthase A  38.62 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1617  tRNA pseudouridine synthase A  36.74 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0232986  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  38.25 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2474  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2696  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2612  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3458  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02243  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1338  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.556339  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2469  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1334  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.673735 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02203  hypothetical protein  37.8 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2510  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 		 270 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2610  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 		 270 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.422355  normal  0.0539335 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002874  tRNA pseudouridine synthase A  37.79 
 
 		 264 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2598  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 		 270 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.814522  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2556  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 		 270 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2719  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 		 270 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.152064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  38.43 
 
 		 252 aa  165  9e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  36.73 
 
 		 245 aa  165  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03101  tRNA pseudouridine synthase A  37.4 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  37.5 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  39.92 
 
 		 249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000390138  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0520  tRNA pseudouridine synthase A  38.13 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2984  tRNA pseudouridine synthase A  36.74 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1560  tRNA pseudouridine synthase A  40.89 
 
 		 302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.949883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  35.12 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3064  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2441  tRNA pseudouridine synthase A  35.98 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238005  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0321  tRNA pseudouridine synthase A  38.58 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566898  hitchhiker  1.98611e-17 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2306  tRNA pseudouridine synthase A  35.36 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0438465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1806  tRNA pseudouridine synthase A  38 
 
 		 266 aa  160  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1426  tRNA pseudouridine synthase A  35.23 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1491  tRNA pseudouridine synthase A  35.23 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.125203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1479  tRNA pseudouridine synthase A  35.23 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0778674  normal  0.668888 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3803  tRNA pseudouridine synthase A  39.43 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 		 271 aa  159  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1652  tRNA pseudouridine synthase A  35.23 
 
 		 261 aa  159  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2836  tRNA pseudouridine synthase A  35.23 
 
 		 261 aa  158  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0418534  hitchhiker  0.00932261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2742  tRNA pseudouridine synthase A  35.23 
 
 		 261 aa  158  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0368715  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1617  tRNA pseudouridine synthase A  35.23 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00313277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3334  tRNA pseudouridine synthase A  35.06 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000208005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  36 
 
 		 259 aa  158  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2759  tRNA pseudouridine synthase A  35.23 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00729091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  37.6 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01204  tRNA pseudouridine synthase A  36.33 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1408  tRNA pseudouridine synthase A  36.61 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2576  tRNA pseudouridine synthase A  35.53 
 
 		 275 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  34.55 
 
 		 246 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  34.55 
 
 		 246 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0364  tRNA pseudouridine synthase A  34.63 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1568  tRNA pseudouridine synthase A  36.47 
 
 		 280 aa  155  6e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.952303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  36.1 
 
 		 245 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  36.1 
 
 		 245 aa  155  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1916  tRNA pseudouridine synthase A  36.18 
 
 		 260 aa  155  9e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.392139  normal  0.974239 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  36.1 
 
 		 245 aa  155  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0346  tRNA pseudouridine synthase A  37.04 
 
 		 262 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000224311  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1931  tRNA pseudouridine synthase A  35.06 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000797555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  35.68 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  34.84 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0785  tRNA pseudouridine synthase A  38 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  35.68 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  35.68 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2081  pseudouridylate synthase  35.63 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.999551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>