More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_46640 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  62.39 
 
 		 812 aa  1035    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  57.65 
 
 		 843 aa  932    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  98.04 
 
 		 816 aa  1597    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  64.28 
 
 		 839 aa  1083    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  100 
 
 		 813 aa  1652    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  40.78 
 
 		 709 aa  515  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  39.75 
 
 		 849 aa  510  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  38.61 
 
 		 738 aa  443  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 758 aa  330  6e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  33.05 
 
 		 755 aa  313  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  33.79 
 
 		 697 aa  311  4e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 751 aa  306  9.000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  32.01 
 
 		 733 aa  303  9e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  30.51 
 
 		 746 aa  302  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  31.02 
 
 		 732 aa  301  3e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 		 726 aa  296  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 		 726 aa  295  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 		 726 aa  295  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  30.92 
 
 		 732 aa  292  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 817 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  30.05 
 
 		 808 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  30.05 
 
 		 808 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 809 aa  273  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  29.21 
 
 		 723 aa  265  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 764 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 742 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  29.29 
 
 		 723 aa  254  6e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 718 aa  253  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 704 aa  249  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 783 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  29.25 
 
 		 771 aa  241  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 745 aa  240  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 745 aa  240  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  28.51 
 
 		 717 aa  236  9e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 725 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  28.25 
 
 		 745 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 725 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 725 aa  235  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 725 aa  235  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 701 aa  232  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 723 aa  229  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 701 aa  229  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 723 aa  226  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 700 aa  223  8e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 723 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 723 aa  220  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  28.61 
 
 		 714 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 710 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 721 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  27.51 
 
 		 721 aa  213  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 817 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 716 aa  209  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  28.49 
 
 		 713 aa  207  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  27.22 
 
 		 704 aa  206  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 698 aa  203  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 728 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 739 aa  173  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 716 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  27.28 
 
 		 713 aa  172  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 753 aa  160  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  25.21 
 
 		 724 aa  158  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  31.96 
 
 		 332 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  30.5 
 
 		 801 aa  103  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 792 aa  99.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.54 
 
 		 861 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  24.66 
 
 		 764 aa  94.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  31.02 
 
 		 739 aa  93.6  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  34.76 
 
 		 807 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  23.34 
 
 		 821 aa  92.8  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 828 aa  89  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  23.65 
 
 		 764 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  31.34 
 
 		 787 aa  87.8  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.85 
 
 		 750 aa  86.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 1000 aa  85.5  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 700 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 700 aa  85.1  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  29.47 
 
 		 809 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 809 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  25.7 
 
 		 797 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 700 aa  84.7  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.49 
 
 		 706 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.49 
 
 		 706 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 828 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 844 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 		 828 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 799 aa  82.8  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  23.97 
 
 		 828 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 700 aa  83.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 700 aa  83.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.49 
 
 		 706 aa  83.2  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  25.13 
 
 		 700 aa  82.8  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 715 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  25.13 
 
 		 700 aa  82.8  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1988  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 1020 aa  81.6  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  29.82 
 
 		 809 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  22.76 
 
 		 859 aa  81.6  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 700 aa  81.3  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.35 
 
 		 721 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.45 
 
 		 706 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 		 809 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>