65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_20860 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_20860  putative Tfp pilus assembly protein FimV  100 
 
 		 681 aa  1316    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1790  motility protein FimV  76.92 
 
 		 683 aa  805    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1815  peptidoglycan-binding LysM  38.39 
 
 		 692 aa  244  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1646  LysM domain protein  33.82 
 
 		 717 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.435509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  38.92 
 
 		 924 aa  187  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  38.34 
 
 		 927 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  35.31 
 
 		 946 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  43.17 
 
 		 931 aa  159  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  35.84 
 
 		 883 aa  159  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1470  LysM domain-containing protein  49.7 
 
 		 595 aa  150  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.368966  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  39.43 
 
 		 1057 aa  138  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  34.57 
 
 		 1245 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  33.24 
 
 		 911 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  37.61 
 
 		 948 aa  135  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  33.52 
 
 		 819 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  33.83 
 
 		 911 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  32.73 
 
 		 914 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  33.06 
 
 		 947 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  33.53 
 
 		 912 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  32.84 
 
 		 896 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  35.37 
 
 		 888 aa  120  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  32.38 
 
 		 806 aa  114  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  33.11 
 
 		 1036 aa  111  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  30.45 
 
 		 897 aa  107  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  30.53 
 
 		 962 aa  99.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_003296  RS04701  hypothetical protein  32.92 
 
 		 673 aa  97.4  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0974302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4871  putative transmembrane protein  32.37 
 
 		 959 aa  96.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.763378  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1714  FimV N-terminal domain protein  23.22 
 
 		 715 aa  94.4  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1701  hypothetical protein  30.32 
 
 		 1041 aa  94  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0554599 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2589  putative transmembrane protein  29.08 
 
 		 885 aa  93.6  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3613  putative transmembrane protein  27.11 
 
 		 889 aa  93.6  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3736  peptidoglycan-binding LysM  29.68 
 
 		 737 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.016486 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3236  putative transmembrane protein  29.08 
 
 		 918 aa  92.4  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  32.26 
 
 		 826 aa  89.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01264  FimV  32.41 
 
 		 658 aa  89.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  25.27 
 
 		 744 aa  89.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  31.3 
 
 		 822 aa  87.4  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3043  putative transmembrane protein  26.05 
 
 		 870 aa  86.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1915  transmembrane protein  30.04 
 
 		 279 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.678129  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1816  hypothetical protein  27.48 
 
 		 969 aa  84.7  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1218  putative transmembrane protein  26.52 
 
 		 938 aa  83.2  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213212 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  41.96 
 
 		 828 aa  82  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0641  hypothetical protein  28.94 
 
 		 640 aa  80.1  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2853  hypothetical protein  28.21 
 
 		 679 aa  79.3  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1418  putative transmembrane protein  33.59 
 
 		 933 aa  78.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1791  peptidoglycan-binding LysM  26.97 
 
 		 877 aa  75.1  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420017  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3066  putative type 4 pilus biogenesis  27.9 
 
 		 1027 aa  73.9  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2140  putative transmembrane protein  25.57 
 
 		 968 aa  73.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.704119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  33.86 
 
 		 952 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  32.17 
 
 		 940 aa  70.1  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  33.94 
 
 		 870 aa  67  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5240  putative transmembrane protein  30.17 
 
 		 964 aa  66.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313298  normal  0.899168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  32.71 
 
 		 883 aa  63.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1258  hypothetical protein  34.19 
 
 		 633 aa  61.2  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1651  hypothetical protein  26.23 
 
 		 945 aa  60.8  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000121455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0519  hypothetical protein  37.93 
 
 		 1621 aa  55.1  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  37.33 
 
 		 1482 aa  53.5  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1074  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1273 aa  50.4  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  44.23 
 
 		 1359 aa  50.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3804  hypothetical protein  43.14 
 
 		 1162 aa  50.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002873  AAA ATPase  36 
 
 		 1454 aa  50.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1565  hypothetical protein  36.84 
 
 		 601 aa  48.5  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.218549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2985  hypothetical protein  34.55 
 
 		 1135 aa  47.8  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00018881  normal  0.421866 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1405  hypothetical protein  35.09 
 
 		 604 aa  47  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3759  hypothetical protein  41.51 
 
 		 411 aa  45.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.57165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>