More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_08791 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_08791  short-chain dehydrogenase/reductase  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07571  short-chain dehydrogenase/reductase  76.92 
 
 		 221 aa  358  2e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07551  short-chain dehydrogenase/reductase  76.92 
 
 		 221 aa  357  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0705  short-chain dehydrogenase/reductase  76.47 
 
 		 221 aa  353  7.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.096337  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14521  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  65.61 
 
 		 221 aa  291  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00861762 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01071  Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities  65.16 
 
 		 221 aa  290  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.315767  normal  0.657338 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1408  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  64.71 
 
 		 224 aa  289  3e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.417919  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07591  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  61.99 
 
 		 221 aa  279  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.82 
 
 		 221 aa  269  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.424112  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0975  short-chain dehydrogenase/reductase  54.3 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.264766  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.12 
 
 		 223 aa  239  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1087  short-chain dehydrogenase/reductase  52.94 
 
 		 221 aa  226  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.236682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0124  short chain dehydrogenase family protein  48.85 
 
 		 219 aa  224  6e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.635136  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4308  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.51 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.54 
 
 		 223 aa  197  9e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.32 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.4 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.85459  normal  0.0309227 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01860  Short chain dehydrogenase family protein  45.62 
 
 		 219 aa  184  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.63 
 
 		 232 aa  151  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.139748 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2690  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.32 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608582  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0735  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.965519  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2459  csgA protein  39.15 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.54228  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 		 231 aa  135  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.110275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115059  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 		 235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2239  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 		 231 aa  128  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  36.68 
 
 		 247 aa  128  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0036356  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1598  putative oxidoreductase protein  35.93 
 
 		 229 aa  125  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1469  short-chain dehydrogenase/reductase  32.9 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002919  short chain dehydrogenase  38.77 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.909495 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35363  predicted protein  36.02 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.267844  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  37.02 
 
 		 232 aa  117  9e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10348  predicted protein  37.23 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.02 
 
 		 232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36622  Predicted short chain-type dehydrogenase  32.79 
 
 		 250 aa  115  3.9999999999999997e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 233 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2058  short chain dehydrogenase / reductase  34.98 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.252145 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03037  hypothetical protein  39.04 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0722078 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 		 224 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11130  short chain dehydrogenase  30.87 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.86 
 
 		 233 aa  105  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0819  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 		 228 aa  104  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122274  normal  0.0405726 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00830  cytoplasm protein, putative  32.46 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.86 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0232972  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0139  short chain dehydrogenase  31.3 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1888  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0400  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  30.22 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0465203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0107  short chain dehydrogenase  31.74 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.950091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4186  short chain dehydrogenase  33.64 
 
 		 222 aa  101  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.88 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32277  short chain dehydrogenase  31.87 
 
 		 256 aa  98.6  6e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.741112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 		 233 aa  99  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.138611  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.51 
 
 		 256 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00155018 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33463  short-chain alcohol dehydrogenase with NAD or NADP as acceptor  38.04 
 
 		 277 aa  97.4  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32278  putative short chain dehydrogenase  32.4 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0133  short chain dehydrogenase  30.74 
 
 		 237 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000794  cell-cell signaling protein C-factor  29.49 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1022  short chain dehydrogenase  28.7 
 
 		 229 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3970  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 		 256 aa  96.3  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000119913  decreased coverage  0.00103281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0125  short chain dehydrogenase  30.74 
 
 		 237 aa  95.9  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54817  putative short chain dehydrogenase  31.2 
 
 		 255 aa  95.5  6e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.176178  normal  0.315077 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0275  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 		 236 aa  95.1  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0287555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0676  short chain dehydrogenase  30.67 
 
 		 231 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000931099  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03161  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family superfamily (AFU_orthologue; AFUA_3G13450)  30 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.560163  normal  0.771081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 		 248 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 		 228 aa  92.8  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.63 
 
 		 228 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.506179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7188  putative glucose/ribitol dehydrogenase  34.41 
 
 		 254 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0083  C factor  30.17 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3390  short chain dehydrogenase  29.55 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.47762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4571  short chain dehydrogenase  29.87 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000728936  hitchhiker  0.00656486 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0460  short chain dehydrogenase  30.57 
 
 		 225 aa  88.2  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3129  short chain dehydrogenase  29.55 
 
 		 226 aa  88.2  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.43 
 
 		 238 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162448  normal  0.562749 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.6 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.76 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.97281  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2727  C-factor, putative  29.1 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.1 
 
 		 256 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09378  conserved hypothetical protein  33.51 
 
 		 282 aa  86.7  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.141306 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.55 
 
 		 238 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460296  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06691  C factor cell-cell signaling protein  28.84 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3270  short chain dehydrogenase  28.64 
 
 		 226 aa  85.5  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2084  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.09 
 
 		 238 aa  85.1  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0860576  normal  0.320515 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0457  C factor cell-cell signaling protein  30.21 
 
 		 235 aa  85.1  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3705  C factor cell-cell signaling protein  29.79 
 
 		 236 aa  84.7  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3702  short chain dehydrogenase  29.78 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.81 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>