More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3529 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
237 aa  473  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.36 
 
 
238 aa  337  8e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162448  normal  0.562749 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.93 
 
 
238 aa  335  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460296  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2084  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.49 
 
 
238 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0860576  normal  0.320515 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.62 
 
 
239 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.62 
 
 
239 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.819367  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.62 
 
 
239 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12179  normal  0.661706 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1888  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.07 
 
 
234 aa  268  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0400  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  56.12 
 
 
234 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0465203  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.95 
 
 
231 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.58 
 
 
233 aa  242  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.41 
 
 
228 aa  175  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0232972  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.6 
 
 
228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.506179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3702  short chain dehydrogenase  42.24 
 
 
227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3390  short chain dehydrogenase  39.74 
 
 
226 aa  159  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.47762 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3129  short chain dehydrogenase  39.74 
 
 
226 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0819  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.34 
 
 
228 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3270  short chain dehydrogenase  39.3 
 
 
226 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 
228 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122274  normal  0.0405726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0766  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  35.06 
 
 
241 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11130  short chain dehydrogenase  38.16 
 
 
229 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0632  short chain dehydrogenase  36.24 
 
 
228 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000159867  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0592  short chain dehydrogenase  35.81 
 
 
228 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23035  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4571  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 
228 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000728936  hitchhiker  0.00656486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0637  short chain dehydrogenase  36.12 
 
 
228 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000253756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0676  short chain dehydrogenase  35.47 
 
 
231 aa  148  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000931099  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0670  short chain dehydrogenase  34.2 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.620328  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.48 
 
 
228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0722078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1022  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 
229 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0377  short chain dehydrogenase  37.18 
 
 
225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.773672 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2239  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 
231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2690  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 
232 aa  124  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608582  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 
224 aa  123  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2977  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
225 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.06 
 
 
232 aa  122  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.139748 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.14 
 
 
231 aa  122  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115059  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 
233 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2840  short chain dehydrogenase  37.02 
 
 
225 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal  0.858614 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1598  putative oxidoreductase protein  32.46 
 
 
229 aa  122  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0107  short chain dehydrogenase  35.44 
 
 
226 aa  121  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.950091 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6271  short chain dehydrogenase  36.75 
 
 
225 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0735  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 
233 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.965519  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2459  csgA protein  30.87 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.54228  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  31.88 
 
 
232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.88 
 
 
232 aa  118  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.74 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0460  short chain dehydrogenase  36.17 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0036356  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2943  short chain dehydrogenase  35.9 
 
 
225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2314  short chain dehydrogenase  35.9 
 
 
225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2928  short chain dehydrogenase  35.9 
 
 
225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002919  short chain dehydrogenase  29.57 
 
 
229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.52 
 
 
166 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4256  short chain dehydrogenase  34.91 
 
 
225 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55035  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0139  short chain dehydrogenase  34.31 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1469  short-chain dehydrogenase/reductase  35.1 
 
 
234 aa  111  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.38 
 
 
231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.110275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0177  short chain dehydrogenase  34.04 
 
 
225 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 
227 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0343  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 
225 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0133  short chain dehydrogenase  32.38 
 
 
237 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0125  short chain dehydrogenase  32.38 
 
 
237 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  30.47 
 
 
247 aa  105  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.86 
 
 
235 aa  105  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0275  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 
236 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0287555  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.11 
 
 
233 aa  102  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.138611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0578  short chain dehydrogenase  35.86 
 
 
225 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0395  short chain dehydrogenase  35.86 
 
 
225 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0097  short chain dehydrogenase  35.86 
 
 
227 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2276  short chain dehydrogenase  35.86 
 
 
227 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0416  short chain dehydrogenase  35.44 
 
 
225 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2011  short chain dehydrogenase  35.86 
 
 
227 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3084  short chain dehydrogenase  35.86 
 
 
227 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.628833  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
231 aa  100  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.909495 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.85459  normal  0.0309227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5986  short chain dehydrogenase  33.62 
 
 
220 aa  95.5  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0124  short chain dehydrogenase family protein  32.54 
 
 
219 aa  95.1  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.635136  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.51 
 
 
234 aa  94.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00144491  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4186  short chain dehydrogenase  32.44 
 
 
222 aa  93.6  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03037  hypothetical protein  32.65 
 
 
193 aa  94.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 
223 aa  93.2  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08791  short-chain dehydrogenase/reductase  30.88 
 
 
221 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.42 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
228 aa  89.4  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4308  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.84 
 
 
230 aa  88.2  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3053  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 
222 aa  88.2  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3775  short chain dehydrogenase  34.62 
 
 
222 aa  85.5  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07551  short-chain dehydrogenase/reductase  28.99 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0705  short-chain dehydrogenase/reductase  29.47 
 
 
221 aa  82  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.096337  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07571  short-chain dehydrogenase/reductase  28.99 
 
 
221 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.97281  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.19 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1408  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  30.19 
 
 
224 aa  79  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.417919  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01071  Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities  30.19 
 
 
221 aa  79  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.315767  normal  0.657338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.37 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35363  predicted protein  29.46 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.267844  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.82 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>