More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2901 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2901  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1134 aa  2315    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.269795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3766  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1146 aa  422  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1991  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1243 aa  349  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302175  normal  0.112109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2317  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 1202 aa  338  2.9999999999999997e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2928  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 1245 aa  271  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1754  TonB-dependent receptor plug  30.02 
 
 		 1243 aa  263  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3377  TonB-dependent receptor plug  33.01 
 
 		 1314 aa  255  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615766  normal  0.66786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0596  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 		 1245 aa  254  6e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0600  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1294 aa  247  8e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2495  TonB-dependent receptor plug  31.99 
 
 		 1247 aa  247  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1755  TonB-dependent receptor plug  31.69 
 
 		 1289 aa  246  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1013  TonB-dependent receptor plug  33.89 
 
 		 1273 aa  246  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3234  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 1221 aa  244  6e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763048  normal  0.0174911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4266  TonB-dependent receptor plug  26.82 
 
 		 1091 aa  244  7e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3199  TonB-dependent receptor plug  31.99 
 
 		 1297 aa  225  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1794  TonB-dependent receptor plug  39.46 
 
 		 1302 aa  194  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1349  TonB-dependent receptor plug  32.72 
 
 		 1232 aa  156  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4279  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1153 aa  134  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  34.84 
 
 		 929 aa  133  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4280  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1144 aa  130  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4287  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 1149 aa  125  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4278  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 		 1146 aa  117  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1267  TonB-dependent receptor  36.41 
 
 		 980 aa  98.2  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  34.95 
 
 		 978 aa  96.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 755 aa  82  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1125  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 967 aa  76.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304926 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  31.53 
 
 		 727 aa  76.3  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0522  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 817 aa  71.6  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  29.75 
 
 		 747 aa  69.7  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  31.72 
 
 		 735 aa  68.9  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 732 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 719 aa  66.6  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  29.67 
 
 		 708 aa  67  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  29.09 
 
 		 821 aa  66.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 733 aa  65.1  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  36.31 
 
 		 724 aa  64.3  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 721 aa  64.3  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 732 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2131  TonB-dependent receptor plug  27.72 
 
 		 757 aa  64.3  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0772564  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  29.33 
 
 		 703 aa  64.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 753 aa  64.3  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3969  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 793 aa  63.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  29.11 
 
 		 694 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 		 724 aa  63.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  25.44 
 
 		 745 aa  62.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  27.52 
 
 		 734 aa  62.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 701 aa  62.4  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  30.26 
 
 		 715 aa  62.4  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  29.89 
 
 		 703 aa  62  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 737 aa  62  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  29.47 
 
 		 710 aa  61.6  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 		 711 aa  61.6  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  28.95 
 
 		 770 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  30.13 
 
 		 736 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.31 
 
 		 703 aa  61.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 735 aa  60.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  30.99 
 
 		 734 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  25.53 
 
 		 730 aa  61.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  25.18 
 
 		 730 aa  60.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  25.18 
 
 		 730 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 701 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  24.9 
 
 		 710 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 		 707 aa  60.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 		 751 aa  60.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  30.59 
 
 		 808 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  29.66 
 
 		 701 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 707 aa  59.7  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  30.63 
 
 		 710 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 708 aa  59.7  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 701 aa  60.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  27.1 
 
 		 690 aa  59.7  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 726 aa  59.3  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2088  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 793 aa  59.3  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0823412 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  25 
 
 		 728 aa  59.3  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 707 aa  58.9  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 726 aa  58.9  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  24.82 
 
 		 730 aa  58.9  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 714 aa  58.9  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 699 aa  58.9  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  33.8 
 
 		 792 aa  58.9  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0837  TonB-dependent siderophore receptor  28.32 
 
 		 759 aa  58.5  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213171  normal  0.109269 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  28.5 
 
 		 729 aa  58.5  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  25.72 
 
 		 731 aa  58.5  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 743 aa  58.5  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2558  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 760 aa  58.5  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.897783  normal  0.0361628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 		 692 aa  58.5  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0089  TonB-dependent siderophore receptor  24.64 
 
 		 699 aa  58.5  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  25.72 
 
 		 731 aa  58.2  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 		 726 aa  58.2  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1440  TonB dependent, hydroxamate-type ferrisiderophore, outer membrane receptor  24.64 
 
 		 699 aa  58.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453975  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 708 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  28.5 
 
 		 729 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  28.5 
 
 		 729 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  26.75 
 
 		 689 aa  57.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 		 710 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 753 aa  56.6  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  28.5 
 
 		 729 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  34.42 
 
 		 714 aa  57  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  28.5 
 
 		 729 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3085  TonB-dependent siderophore receptor  30.2 
 
 		 767 aa  57.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  0.216415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>