More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1991 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3234  TonB-dependent receptor plug  39.68 
 
 		 1221 aa  793    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763048  normal  0.0174911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3199  TonB-dependent receptor plug  52.56 
 
 		 1297 aa  1253    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0600  TonB-dependent receptor plug  53.66 
 
 		 1294 aa  1264    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2495  TonB-dependent receptor plug  36.21 
 
 		 1247 aa  640    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3377  TonB-dependent receptor plug  36.57 
 
 		 1314 aa  680    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615766  normal  0.66786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1991  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1243 aa  2523    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302175  normal  0.112109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1013  TonB-dependent receptor plug  43.02 
 
 		 1273 aa  867    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0596  TonB-dependent receptor plug  79.15 
 
 		 1245 aa  2016    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1794  TonB-dependent receptor plug  33.93 
 
 		 1302 aa  595  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2317  TonB-dependent receptor plug  34.13 
 
 		 1202 aa  580  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1754  TonB-dependent receptor plug  35.25 
 
 		 1243 aa  573  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1755  TonB-dependent receptor plug  34.13 
 
 		 1289 aa  572  1e-161  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3766  TonB-dependent receptor plug  33.44 
 
 		 1146 aa  555  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2928  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 1245 aa  461  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2901  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 		 1134 aa  249  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.269795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  38.82 
 
 		 929 aa  172  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1349  TonB-dependent receptor plug  35.61 
 
 		 1232 aa  160  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4279  TonB-dependent receptor plug  33.1 
 
 		 1153 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4287  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1149 aa  145  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4278  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 1146 aa  143  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4280  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 1144 aa  138  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4266  TonB-dependent receptor plug  35.05 
 
 		 1091 aa  133  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 978 aa  110  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1267  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 980 aa  94.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 755 aa  80.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  30.59 
 
 		 732 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 727 aa  76.3  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 		 701 aa  75.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 		 701 aa  75.5  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 		 701 aa  75.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 		 701 aa  75.5  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 		 701 aa  75.5  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 		 732 aa  75.1  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1808  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 		 739 aa  75.1  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2131  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 		 757 aa  74.7  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0772564  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  28.5 
 
 		 722 aa  73.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 710 aa  72.8  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.7 
 
 		 833 aa  72.4  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3560  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 		 710 aa  71.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 		 701 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 737 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 715 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 694 aa  70.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1125  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 967 aa  69.7  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304926 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  26.89 
 
 		 708 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 748 aa  69.3  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 748 aa  69.3  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  27.34 
 
 		 703 aa  69.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  27.44 
 
 		 740 aa  69.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  27.85 
 
 		 703 aa  68.6  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0522  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 817 aa  68.6  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 734 aa  68.2  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3085  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 		 767 aa  68.2  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  0.216415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 749 aa  67.8  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 723 aa  67.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  23.05 
 
 		 779 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  30.27 
 
 		 757 aa  67.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3722  TonB-dependent receptor plug  24.23 
 
 		 896 aa  67  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.275954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  28.32 
 
 		 699 aa  67  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0947  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 		 683 aa  67  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0779656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  25.93 
 
 		 518 aa  67  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 		 722 aa  66.6  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 707 aa  66.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  25.68 
 
 		 862 aa  66.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 		 733 aa  66.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 711 aa  66.6  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 		 797 aa  66.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3640  TonB-dependent siderophore receptor  27.47 
 
 		 708 aa  65.9  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168279  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  24.17 
 
 		 753 aa  66.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 797 aa  65.5  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  27.13 
 
 		 689 aa  65.9  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 797 aa  65.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  23.7 
 
 		 692 aa  65.1  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 701 aa  65.1  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 737 aa  64.7  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 734 aa  64.7  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 736 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 		 736 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  26.51 
 
 		 794 aa  64.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 829 aa  64.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 701 aa  64.3  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2399  TonB-dependent siderophore receptor  22.81 
 
 		 729 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  29.9 
 
 		 776 aa  63.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1352  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 832 aa  63.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 		 732 aa  63.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 		 742 aa  63.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  29.48 
 
 		 741 aa  63.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  24.88 
 
 		 722 aa  63.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  26.03 
 
 		 701 aa  62.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 		 714 aa  62.8  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  22.86 
 
 		 806 aa  62.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  23.89 
 
 		 735 aa  62.4  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  25.59 
 
 		 745 aa  62.4  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2558  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 760 aa  62.4  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.897783  normal  0.0361628 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  28.96 
 
 		 709 aa  62.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3723  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 767 aa  62.4  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  25.19 
 
 		 743 aa  62  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  24.24 
 
 		 710 aa  61.6  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  26.19 
 
 		 738 aa  61.6  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  25 
 
 		 799 aa  60.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>