More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2981 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_2981  RpiR family transcriptional regulator  100 
 
 		 282 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4532  RpiR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 313 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.872483  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4066  RpiR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 303 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0160  RpiR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1500  RpiR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3429  RpiR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3411  transcriptional regulator, RpiR family  28.88 
 
 		 278 aa  99.4  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1233  RpiR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 280 aa  99  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0156819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1407  RpiR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 280 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2080  transcriptional regulator, RpiR family  28.62 
 
 		 285 aa  92.4  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0450  RpiR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 272 aa  92.4  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3450  RpiR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2659  RpiR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3330  RpiR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3191  RpiR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1331  RpiR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 314 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2787  transcriptional regulator, RpiR family  31.75 
 
 		 296 aa  85.5  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000772388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3314  transcriptional regulator, RpiR family  22.74 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3470  transcriptional regulator, RpiR family  24.64 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02491  putative rpiR-family transcriptional regulatory protein  27.34 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0931  RpiR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0628212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0876  transcriptional regulator, RpiR family  24.28 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0906  transcriptional regulator, RpiR family  22.83 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.505749  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0959  transcriptional regulator  30.22 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.396174 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3564  RpiR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.536409  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1590  RpiR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2057  RpiR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1321  transcriptional regulator, RpiR family  23.59 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1338  RpiR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.298228  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1149  RpiR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0445331  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1590  RpiR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000388341  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1541  RpiR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000907266  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1080  RpiR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0801962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2807  RpiR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2428  DNA-binding helix-turn-helix domain-containing transcriptional regulator protein  28.57 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.451037  normal  0.0398697 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  28.26 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1243  transcriptional regulator  26.29 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.665754  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1741  hypothetical protein  26.2 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.535544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4698  transcriptional regulator, RpiR family  25.11 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1355  transcriptional regulator  25.35 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.906845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4661  RpiR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0304  transcriptional regulator  23.26 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2832  RpiR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.233384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1734  transcriptional regulator, RpiR family  23.95 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3695  RpiR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0160312  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4542  RpiR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23580  transcriptional regulator  28.42 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2133  RpiR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80072 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3876  RpiR family transcriptional regulator  25 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1044  RpiR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408154  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2581  RpiR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  hitchhiker  0.000000255705 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1605  RpiR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1333  transcriptional regulator, RpiR family  25 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0674  RpiR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2324  RpiR family transcriptional regulator  22.03 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0607  RpiR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173614  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0593  RpiR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590128  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3592  RpiR family transcriptional regulator  21.68 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0397  sugar isomerase (SIS)  23.88 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2324  RpiR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.284245  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0998  RpiR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.962944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4060  RpiR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1784  RpiR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760228  hitchhiker  0.0000000136615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2180  RpiR family transcriptional regulator  21.68 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3004  transcriptional regulator, RpiR family  24.55 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  27.23 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3344  transcriptional regulator, RpiR family  23.29 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2724  RpiR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2674  transcriptional regulator, RpiR family  28.78 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0539121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0343  RpiR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4885  putative transcriptional regulator, RpiR family  26.72 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.586943  normal  0.761042 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1216  RpiR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.3152  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0684  putative transcriptional regulator  24.89 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.615346  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2602  RpiR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3855  RpiR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  27.88 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0554  RpiR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.335525  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0580  RpiR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658912  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5348  RpiR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.391246 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3745  RpiR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3246  RpiR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.960864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3444  RpiR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2447  RpiR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4021  RpiR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 306 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3444  RpiR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4477  RpiR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600704  normal  0.42821 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2634  RpiR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4771  putative RpiR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.978774  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1223  RpiR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.809611  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4736  RpiR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1524  transcriptional regulator  22.88 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3409  RpiR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.977628  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1915  RpiR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0365  RpiR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1152  RpiR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 335 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2833  RpiR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1411  transcriptional regulator, RpiR family  27.86 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0626  RpiR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0659  RpiR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>