More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_3550 on replicon NC_009363
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009363  OSTLU_3550  predicted protein  100 
 
 
257 aa  534  1e-151  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.658668  normal  0.123693 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84338  pseudouridine synthase  38.81 
 
 
465 aa  195  7e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.188482  normal  0.052244 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00670  pseudouridylate synthase, putative  36.71 
 
 
514 aa  187  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03170  pseudouridylate synthase 3 (AFU_orthologue; AFUA_3G13350)  34.52 
 
 
664 aa  187  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_5217  predicted protein  45.41 
 
 
216 aa  175  7e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0989  tRNA pseudouridine synthase A  34.14 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0217  tRNA pseudouridine synthase ACD  32.52 
 
 
276 aa  115  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  33.33 
 
 
259 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2400  tRNA pseudouridine synthase ACD  32.43 
 
 
276 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2301  tRNA pseudouridine synthase ACD  33.03 
 
 
270 aa  102  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2714  tRNA pseudouridine synthase ACD  33.74 
 
 
280 aa  97.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.971768  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1332  tRNA pseudouridine synthase A  32.6 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1675  tRNA pseudouridine synthase ACD  30.89 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.352236  hitchhiker  0.000000344781 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2681  tRNA pseudouridine synthase A  31.11 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0556679  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0126  tRNA pseudouridine synthase A  30.33 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000150331  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  26.44 
 
 
248 aa  92  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  26.44 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1625  tRNA pseudouridine synthase A  30.4 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.875957  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2984  tRNA pseudouridine synthase A  30.15 
 
 
261 aa  89  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0686  tRNA pseudouridine synthase ACD  30.04 
 
 
246 aa  88.6  8e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000903127  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1528  tRNA pseudouridine synthase A  32.5 
 
 
286 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141519  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2273  tRNA pseudouridine synthase A  30.77 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000217948 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1652  tRNA pseudouridine synthase A  28.24 
 
 
261 aa  87  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  28.46 
 
 
249 aa  86.7  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000390138  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3767  tRNA pseudouridine synthase A  31.67 
 
 
332 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2246  tRNA pseudouridine synthase A  29.77 
 
 
267 aa  86.3  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000374145  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2287  tRNA pseudouridine synthase A  29.77 
 
 
267 aa  86.3  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0252642  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1555  tRNA pseudouridine synthase A  31.67 
 
 
284 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1051  tRNA pseudouridine synthase A  31.02 
 
 
255 aa  85.9  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000873816  hitchhiker  0.00519599 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  27.86 
 
 
250 aa  85.5  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2040  tRNA pseudouridine synthase A  28.21 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545725  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  26.97 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2081  pseudouridylate synthase  29.6 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.999551 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  27.2 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  30.53 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  26.56 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  26.82 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  26.56 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  27.97 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  27.97 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21360  pseudouridylate synthase I  29.18 
 
 
271 aa  82  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0418388  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  27.59 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  27.59 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  27.59 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  27.59 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  27.8 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  27.59 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3371  Pseudouridine synthase I, TruA, alpha/beta domain protein  29.26 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  27.59 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  28.57 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  27.2 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  25.95 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1700  tRNA pseudouridine synthase A  30.42 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.125972 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1416  tRNA pseudouridine synthase A  28.34 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3871  tRNA pseudouridine synthase A  31.56 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1800  tRNA pseudouridine synthase A  30.77 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  28.24 
 
 
261 aa  79  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0255  tRNA pseudouridine synthase A  30 
 
 
250 aa  79  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00104612  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0746  tRNA pseudouridine synthase A  27.59 
 
 
247 aa  79  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.57289e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2139  tRNA pseudouridine synthase A  30.33 
 
 
274 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357252  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  28.45 
 
 
271 aa  78.6  0.00000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  27.08 
 
 
244 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12020  pseudouridylate synthase I  31.75 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2469  tRNA pseudouridine synthase A  31.6 
 
 
278 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.371859 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23840  tRNA pseudouridine synthase A  31.82 
 
 
285 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866913  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1013  tRNA pseudouridine synthase A  28.46 
 
 
245 aa  78.6  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00481076  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1859  tRNA pseudouridine synthase ACD  28.63 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  28.63 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2867  tRNA pseudouridine synthase A  29.1 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.42429 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  28.14 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  26.82 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13492  tRNA pseudouridine synthase A  29.3 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.39431  normal  0.20778 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0468  tRNA pseudouridine synthase A  28.63 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000442967  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1175  tRNA pseudouridine synthase A  28.29 
 
 
253 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.261971  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1395  tRNA pseudouridine synthase A  30.29 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1417  tRNA pseudouridine synthase A  30.86 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2726  tRNA pseudouridine synthase A  30.57 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0677  tRNA pseudouridine synthase A  31.54 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.873291  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1544  tRNA pseudouridine synthase A  29.76 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14908  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1491  tRNA pseudouridine synthase A  28.4 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.125203  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1479  tRNA pseudouridine synthase A  28.4 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0778674  normal  0.668888 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1426  tRNA pseudouridine synthase A  28.4 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400831  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1626  tRNA pseudouridine synthase A  27.08 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.895885  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2308  tRNA pseudouridine synthase A  29.72 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.742773  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0520  tRNA pseudouridine synthase A  28.63 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2717  tRNA pseudouridine synthase A  32.13 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0374382 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04290  pseudouridylate synthase I  28.83 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477492  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2019  tRNA pseudouridine synthase A  31.4 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0292827  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1856  tRNA pseudouridine synthase A  31.12 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0227794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  28.35 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  27.84 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1723  tRNA pseudouridine synthase A  31.12 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2616  tRNA pseudouridine synthase A  30.17 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0771  tRNA pseudouridine synthase A  31.12 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  27.84 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1815  tRNA pseudouridine synthase A  29.51 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2309  tRNA pseudouridine synthase A  31.12 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622933  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0527  tRNA pseudouridine synthase A  31.12 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2447  tRNA pseudouridine synthase A  31.12 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.808323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1647  tRNA pseudouridine synthase A  31.12 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>