157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0896 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0896  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 149 aa  286  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.221144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  58.49 
 
 		 864 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  41.8 
 
 		 836 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  49.49 
 
 		 863 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  44.88 
 
 		 819 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  46.07 
 
 		 812 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  46.74 
 
 		 833 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  44.19 
 
 		 778 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  41.25 
 
 		 817 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  41.25 
 
 		 808 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  41.25 
 
 		 808 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  36.21 
 
 		 844 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0725  TonB-dependent receptor protein  35.46 
 
 		 633 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  34.85 
 
 		 794 aa  62.8  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  45.05 
 
 		 812 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  46.03 
 
 		 804 aa  60.5  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  38.04 
 
 		 817 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  38.55 
 
 		 973 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  33.98 
 
 		 795 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  32.37 
 
 		 821 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  33.06 
 
 		 822 aa  57.4  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  41.77 
 
 		 881 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  41.77 
 
 		 921 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  41.77 
 
 		 921 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  41.77 
 
 		 881 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  41.77 
 
 		 881 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.36 
 
 		 833 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  43.33 
 
 		 815 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  39.02 
 
 		 828 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  40.79 
 
 		 1186 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  37.97 
 
 		 822 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4653  TonB-dependent receptor plug  38.64 
 
 		 836 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  36.14 
 
 		 792 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  34.26 
 
 		 815 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  45.16 
 
 		 784 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  29.47 
 
 		 816 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  43.75 
 
 		 829 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  35.29 
 
 		 807 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2215  hypothetical protein  33.96 
 
 		 229 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.231176 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  38.54 
 
 		 841 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  38.16 
 
 		 797 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  38.55 
 
 		 809 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  35.58 
 
 		 835 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  30.19 
 
 		 518 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  40.51 
 
 		 882 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  35.24 
 
 		 809 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  47.37 
 
 		 863 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  31.25 
 
 		 861 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  39.02 
 
 		 828 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2100  hypothetical protein  36.14 
 
 		 276 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.223696  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  35.06 
 
 		 821 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  36.36 
 
 		 851 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  34.29 
 
 		 809 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  38.81 
 
 		 802 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  37.8 
 
 		 879 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3810  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 934 aa  50.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0593009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  31.43 
 
 		 809 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  37.8 
 
 		 839 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  35.44 
 
 		 778 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  34.41 
 
 		 801 aa  50.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  34.67 
 
 		 809 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4077  cyclic nucleotide-binding protein  35.16 
 
 		 959 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 		 791 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  36.94 
 
 		 787 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  40.62 
 
 		 807 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2907  secretin/TonB-like protein  34.57 
 
 		 226 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0997  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 935 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  37.31 
 
 		 779 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  29.47 
 
 		 813 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  46.67 
 
 		 840 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2296  TonB-dependent receptor  33.93 
 
 		 752 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  37.38 
 
 		 858 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4401  TonB-dependent receptor  36.45 
 
 		 756 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78723  normal  0.0995472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4301  TonB-dependent receptor  33.71 
 
 		 1018 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.15211 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  42.86 
 
 		 829 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  36.71 
 
 		 855 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  34.88 
 
 		 883 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  36.71 
 
 		 855 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  31.13 
 
 		 791 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  41.38 
 
 		 816 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  31.11 
 
 		 798 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0658  secretin/TonB  36.56 
 
 		 507 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2303  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 982 aa  47  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243733  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  38.57 
 
 		 809 aa  47  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 		 808 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2186  TonB-dependent receptor  35.09 
 
 		 1040 aa  47  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.996858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  38.6 
 
 		 802 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  33.05 
 
 		 821 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  37.88 
 
 		 799 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  35.9 
 
 		 795 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  35.82 
 
 		 782 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  28.07 
 
 		 814 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.76 
 
 		 825 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  34.85 
 
 		 777 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2211  hypothetical protein  34.62 
 
 		 237 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  36.49 
 
 		 862 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64710  putative extracellular heme-binding protein  35.94 
 
 		 989 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.572363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2383  TonB-dependent receptor  34.18 
 
 		 926 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2622  TonB-dependent receptor plug  36.56 
 
 		 743 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00560047  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  35 
 
 		 847 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>