More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0658 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0658  secretin/TonB  100 
 
 		 507 aa  1030    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  53.54 
 
 		 864 aa  481  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  38.98 
 
 		 844 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  38.03 
 
 		 833 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  35.36 
 
 		 836 aa  280  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  36.27 
 
 		 812 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  33.12 
 
 		 841 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  34.86 
 
 		 841 aa  257  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  32.91 
 
 		 841 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  37.45 
 
 		 803 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  35.18 
 
 		 815 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  36.22 
 
 		 826 aa  240  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  34.38 
 
 		 789 aa  239  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 		 840 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  32.77 
 
 		 828 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  35.46 
 
 		 802 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  34.59 
 
 		 824 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  34.3 
 
 		 814 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  33.05 
 
 		 828 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  34.47 
 
 		 807 aa  229  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  33.74 
 
 		 812 aa  230  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  34.54 
 
 		 799 aa  229  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 		 816 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  34.36 
 
 		 803 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  34.97 
 
 		 831 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  34.16 
 
 		 825 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  34.97 
 
 		 802 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  34.95 
 
 		 798 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.25 
 
 		 825 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  32.7 
 
 		 806 aa  218  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  34 
 
 		 821 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  33.12 
 
 		 800 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  38.25 
 
 		 703 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  33.83 
 
 		 822 aa  214  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  32.76 
 
 		 822 aa  213  7.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  33.61 
 
 		 778 aa  213  7.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  31.59 
 
 		 808 aa  210  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  32.16 
 
 		 819 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  32.3 
 
 		 841 aa  209  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  32.96 
 
 		 809 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  33.94 
 
 		 801 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  31.26 
 
 		 795 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  34.59 
 
 		 827 aa  204  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  30.46 
 
 		 826 aa  203  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  38.51 
 
 		 746 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  32.43 
 
 		 810 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 		 745 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  31.72 
 
 		 787 aa  196  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 		 738 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 		 738 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 		 727 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.88 
 
 		 743 aa  193  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  32.06 
 
 		 830 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  32.16 
 
 		 817 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  35.94 
 
 		 732 aa  189  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  34.38 
 
 		 713 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  39.56 
 
 		 722 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  34.38 
 
 		 720 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  31.97 
 
 		 730 aa  187  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  32.01 
 
 		 803 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2076  TonB-dependent receptor  54.71 
 
 		 533 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  36.81 
 
 		 724 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  31.9 
 
 		 840 aa  183  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  34.2 
 
 		 722 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  31.43 
 
 		 822 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  33.24 
 
 		 766 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  31.79 
 
 		 747 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  39.29 
 
 		 717 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  36.34 
 
 		 821 aa  177  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0400  ferripyoverdine receptor  35.15 
 
 		 744 aa  177  5e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.736403  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  32.14 
 
 		 753 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  34.72 
 
 		 699 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  32.9 
 
 		 741 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  34.72 
 
 		 753 aa  174  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  30.98 
 
 		 719 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  30.98 
 
 		 719 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  30.43 
 
 		 752 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  34.66 
 
 		 725 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  32.79 
 
 		 748 aa  167  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  38.3 
 
 		 829 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  31.75 
 
 		 737 aa  163  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  31.43 
 
 		 747 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3033  ferric alcaligin siderophore receptor  35.06 
 
 		 700 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  31.59 
 
 		 747 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  31.43 
 
 		 741 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.9 
 
 		 729 aa  161  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1507  TonB-dependent siderophore receptor  31.07 
 
 		 737 aa  161  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.681157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  31.17 
 
 		 741 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1517  TonB-dependent siderophore receptor  31.17 
 
 		 737 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134645  normal  0.877607 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1451  TonB-dependent siderophore receptor  31.17 
 
 		 737 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  31.89 
 
 		 729 aa  157  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.89 
 
 		 729 aa  157  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.89 
 
 		 729 aa  157  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  31.85 
 
 		 723 aa  157  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 720 aa  156  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  30.45 
 
 		 723 aa  156  9e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.89 
 
 		 729 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0114  TonB-dependent siderophore receptor  30.88 
 
 		 728 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4286  TonB-dependent siderophore receptor  31.16 
 
 		 728 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.63 
 
 		 729 aa  154  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>