More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4017 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4017  inner-membrane translocator  100 
 
 		 697 aa  1335    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8309  inner-membrane translocator  45.54 
 
 		 652 aa  436  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.507178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3867  inner-membrane translocator  41.07 
 
 		 704 aa  337  5.999999999999999e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.318133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3489  inner-membrane translocator  38.13 
 
 		 743 aa  329  8e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1980  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component-like protein  33.44 
 
 		 898 aa  246  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2952  ABC transporter related  36.36 
 
 		 930 aa  226  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3395  ABC transporter related  34.55 
 
 		 956 aa  212  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5664  inner-membrane translocator  32.19 
 
 		 741 aa  207  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269421  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2136  ABC transporter related protein  34.83 
 
 		 908 aa  206  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0855  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 772 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.852549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4737  ABC transporter related  29.61 
 
 		 940 aa  173  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8833  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 637 aa  165  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.756263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0381  inner-membrane translocator  33.95 
 
 		 692 aa  152  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3222  inner-membrane translocator  30.04 
 
 		 684 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4038  inner-membrane translocator  28.24 
 
 		 816 aa  147  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3350  inner-membrane translocator  32.02 
 
 		 659 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5562  ABC transporter related  29.53 
 
 		 891 aa  140  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1283  ABC transporter related  31.25 
 
 		 1087 aa  140  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.887426  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4486  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 661 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  28.21 
 
 		 950 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4564  ABC transporter related  27.99 
 
 		 989 aa  131  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  32.42 
 
 		 309 aa  131  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3859  ABC transporter related protein  29.83 
 
 		 924 aa  127  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3456  ABC transporter related  31.81 
 
 		 1302 aa  127  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.66499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  27.97 
 
 		 951 aa  126  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 309 aa  125  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  30.61 
 
 		 338 aa  119  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  32.21 
 
 		 311 aa  117  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 309 aa  115  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 309 aa  115  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  30.17 
 
 		 309 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 309 aa  113  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 358 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  29.83 
 
 		 309 aa  110  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 309 aa  109  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  30.48 
 
 		 309 aa  109  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0945  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  30.49 
 
 		 294 aa  107  5e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0829  inner-membrane translocator  30.08 
 
 		 294 aa  107  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_816  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.49 
 
 		 294 aa  107  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.648564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 319 aa  107  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  30.93 
 
 		 335 aa  106  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 293 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  34.47 
 
 		 643 aa  104  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  32.11 
 
 		 381 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7078  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  31.15 
 
 		 292 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 316 aa  103  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2866  inner-membrane translocator  32.21 
 
 		 311 aa  103  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4711  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 292 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3248  ABC transporter related  27.36 
 
 		 959 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2318  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 311 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  hitchhiker  0.00247249 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  35.51 
 
 		 646 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2708  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 311 aa  102  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  33.2 
 
 		 648 aa  102  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  29.27 
 
 		 290 aa  101  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.1 
 
 		 646 aa  101  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1616  inner-membrane translocator  26.72 
 
 		 622 aa  101  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0311969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  27.87 
 
 		 292 aa  101  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.3 
 
 		 325 aa  99.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 415 aa  99.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4242  inner-membrane translocator  30.37 
 
 		 292 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0350  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 292 aa  99.4  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.018915  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  27.49 
 
 		 603 aa  99.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.04 
 
 		 316 aa  99  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3190  ABC transporter related  28.59 
 
 		 956 aa  99  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  28.18 
 
 		 291 aa  98.6  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1544  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 297 aa  98.6  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  30.4 
 
 		 316 aa  98.6  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  26.98 
 
 		 603 aa  98.2  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.4 
 
 		 316 aa  98.2  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.04 
 
 		 316 aa  98.2  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3841  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 294 aa  98.2  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00122547  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  25.43 
 
 		 656 aa  98.2  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  28.98 
 
 		 317 aa  98.2  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.4 
 
 		 316 aa  98.6  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3152  ABC transporter related  29.34 
 
 		 943 aa  97.8  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1742  inner-membrane translocator  30.37 
 
 		 292 aa  98.2  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0350501  normal  0.0888724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  24.79 
 
 		 628 aa  97.8  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  29.67 
 
 		 316 aa  97.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  29.67 
 
 		 316 aa  97.4  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  29.67 
 
 		 316 aa  97.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  29.67 
 
 		 316 aa  97.4  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  29.67 
 
 		 316 aa  97.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  29.67 
 
 		 316 aa  97.4  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2440  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  30.66 
 
 		 311 aa  97.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  34.76 
 
 		 358 aa  96.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  32.78 
 
 		 647 aa  96.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.59 
 
 		 316 aa  96.3  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  27.39 
 
 		 603 aa  95.5  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  28.96 
 
 		 291 aa  94.7  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  32.38 
 
 		 407 aa  94.7  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.36 
 
 		 290 aa  94.7  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0138  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 358 aa  94.4  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  30.57 
 
 		 290 aa  94.4  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  29.3 
 
 		 316 aa  94.4  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  26.88 
 
 		 603 aa  94.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  29.89 
 
 		 295 aa  94.4  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.67 
 
 		 316 aa  94  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1156  inner-membrane translocator  30.54 
 
 		 354 aa  93.6  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.412429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  26.88 
 
 		 603 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.07 
 
 		 562 aa  93.2  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>