85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0489 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  100 
 
 		 665 aa  1336    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  21.88 
 
 		 667 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  21.38 
 
 		 669 aa  112  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  21.76 
 
 		 649 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  20.83 
 
 		 688 aa  103  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  20.5 
 
 		 688 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  21.17 
 
 		 688 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  20.5 
 
 		 688 aa  99  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  21.97 
 
 		 632 aa  97.8  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  20.35 
 
 		 688 aa  97.1  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  21.36 
 
 		 735 aa  96.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  19.97 
 
 		 680 aa  94.4  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  18.22 
 
 		 740 aa  93.6  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  20.31 
 
 		 688 aa  92  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  20.51 
 
 		 691 aa  92  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  21.14 
 
 		 670 aa  89  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  20.12 
 
 		 689 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  20.84 
 
 		 782 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  20.06 
 
 		 689 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  21.74 
 
 		 657 aa  84  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  21.72 
 
 		 759 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  21.52 
 
 		 678 aa  82.8  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  22.17 
 
 		 764 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  21.91 
 
 		 818 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  20.71 
 
 		 839 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  21.91 
 
 		 830 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  21.91 
 
 		 830 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  21.91 
 
 		 830 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  21.91 
 
 		 830 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  21.91 
 
 		 830 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  21.91 
 
 		 830 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  21.91 
 
 		 824 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  21.84 
 
 		 765 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  21.11 
 
 		 832 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  21.46 
 
 		 765 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  21.46 
 
 		 765 aa  77  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  21.46 
 
 		 765 aa  77  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  23.4 
 
 		 656 aa  75.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  19.58 
 
 		 677 aa  75.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  20.61 
 
 		 765 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  21.34 
 
 		 765 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  20.61 
 
 		 765 aa  74.3  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  19.87 
 
 		 704 aa  72.4  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  20.2 
 
 		 669 aa  72  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  20.07 
 
 		 664 aa  71.2  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  19.53 
 
 		 762 aa  71.2  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  20.45 
 
 		 810 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  20.61 
 
 		 791 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  21.95 
 
 		 700 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  19.85 
 
 		 686 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  21 
 
 		 761 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  20.38 
 
 		 791 aa  65.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  19.67 
 
 		 669 aa  66.6  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  19.84 
 
 		 686 aa  65.5  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  19.55 
 
 		 686 aa  65.1  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  19.55 
 
 		 691 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  19.55 
 
 		 691 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  19.55 
 
 		 686 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  19.55 
 
 		 691 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  19.55 
 
 		 686 aa  64.3  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  19.4 
 
 		 686 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  21.52 
 
 		 674 aa  61.2  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  22.35 
 
 		 737 aa  60.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  19.97 
 
 		 686 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  19.97 
 
 		 686 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  19.97 
 
 		 686 aa  59.3  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  19.97 
 
 		 686 aa  59.3  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  20.06 
 
 		 686 aa  58.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  24.05 
 
 		 587 aa  57  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  28.12 
 
 		 1077 aa  55.8  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  24.72 
 
 		 895 aa  52.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  19.23 
 
 		 710 aa  50.8  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  23.64 
 
 		 677 aa  49.3  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1137  AsmA family protein  28.7 
 
 		 265 aa  49.3  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0909358 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  24.86 
 
 		 609 aa  47.8  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  23.91 
 
 		 797 aa  47.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  22.18 
 
 		 1146 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  19.49 
 
 		 607 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1716  AsmA family protein  24.2 
 
 		 867 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  21.55 
 
 		 818 aa  45.8  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  23.14 
 
 		 502 aa  45.4  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  23.14 
 
 		 508 aa  45.4  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  19.25 
 
 		 697 aa  45.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  24.74 
 
 		 640 aa  44.7  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  26.62 
 
 		 640 aa  44.3  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>