More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1971 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1971  secretion protein HlyD  100 
 
 		 362 aa  730    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3424  secretion protein HlyD  44.83 
 
 		 412 aa  288  8e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3581  secretion protein HlyD  45.32 
 
 		 407 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1334  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  45.25 
 
 		 393 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0169276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0380  secretion protein HlyD  41.49 
 
 		 400 aa  238  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0970  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.72 
 
 		 375 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0450  RND family efflux transporter MFP subunit  38.53 
 
 		 407 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.825026 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.69 
 
 		 379 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000851177  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2372  RND family efflux transporter MFP subunit  36.25 
 
 		 395 aa  209  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.89 
 
 		 440 aa  206  4e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1025  RND family efflux transporter MFP subunit  36.31 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0127798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1651  secretion protein HlyD  33.62 
 
 		 407 aa  200  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.986785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0900  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.95 
 
 		 384 aa  199  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000108273  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3395  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.36 
 
 		 389 aa  196  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1610  RND family efflux transporter MFP subunit  34.36 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.665479  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3689  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.24 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2499  RND family efflux transporter MFP subunit  36.78 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.04 
 
 		 391 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0346  RND family efflux transporter MFP subunit  37.76 
 
 		 360 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.499232  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0533  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.26 
 
 		 381 aa  189  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4556  RND family efflux transporter MFP subunit  34.01 
 
 		 383 aa  189  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589535  normal  0.76991 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2482  secretion protein HlyD  36.17 
 
 		 434 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179732  normal  0.227362 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2569  secretion protein HlyD  38.1 
 
 		 462 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  37.23 
 
 		 426 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3585  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.53 
 
 		 435 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2753  HlyD family secretion protein  36.78 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  36.92 
 
 		 426 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  34.2 
 
 		 419 aa  186  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0601  secretion protein HlyD  37.5 
 
 		 459 aa  185  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251315  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2186  RND family efflux transporter MFP subunit  36.22 
 
 		 435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0838  RND family efflux transporter MFP subunit  34.75 
 
 		 387 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1549  membrane fusion protein precursor  35.41 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0135  RND family efflux transporter MFP subunit  36.1 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  35.71 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  35.48 
 
 		 413 aa  183  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0736  RND family efflux transporter MFP subunit  33.82 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1488  RND family efflux transporter MFP subunit  34.66 
 
 		 411 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0971  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.59 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4389  RND family efflux transporter MFP subunit  34.64 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0818366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3252  RND family efflux transporter MFP subunit  35.26 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1312  multidrug efflux system subunit MdtA  34.95 
 
 		 410 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164615  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2966  multidrug efflux system subunit MdtA  34.65 
 
 		 413 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.874422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2558  secretion protein HlyD  36.09 
 
 		 451 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5556  HlyD family secretion protein  34.55 
 
 		 460 aa  179  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1523  secretion protein HlyD  36.75 
 
 		 457 aa  179  8e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  36.26 
 
 		 407 aa  179  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1364  membrane fusion protein MdtA  36.87 
 
 		 442 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.284522  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2329  RND family efflux transporter MFP subunit  34.98 
 
 		 436 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.4455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  35.17 
 
 		 414 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1332  multidrug efflux system subunit MdtA  36.04 
 
 		 444 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2530  RND family efflux transporter MFP subunit  36.39 
 
 		 412 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2670  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  36.39 
 
 		 426 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.768547  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1951  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  36.99 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2826  secretion protein HlyD  35.22 
 
 		 464 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45041 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2065  secretion protein HlyD  36.69 
 
 		 454 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1215  multidrug efflux system subunit MdtA  36.04 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3103  multidrug efflux system subunit MdtA  36.04 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  36.75 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1643  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  36.09 
 
 		 414 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0226554  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.04 
 
 		 462 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3170  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  36.09 
 
 		 412 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2144  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  36.09 
 
 		 412 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.04 
 
 		 462 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1369  membrane fusion protein MdtA  36.49 
 
 		 445 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1418  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  36.09 
 
 		 425 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0732  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.63 
 
 		 440 aa  176  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2583  RND family efflux transporter MFP subunit  36.09 
 
 		 411 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  34.33 
 
 		 449 aa  175  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.6 
 
 		 416 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1501  HlyD family secretion protein  37.35 
 
 		 445 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310778  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2902  secretion protein HlyD  37.2 
 
 		 464 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1510  secretion protein HlyD  33.88 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.31 
 
 		 455 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416467  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4319  RND family efflux transporter MFP subunit  33.62 
 
 		 460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0569861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45910  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  36.06 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.170535  normal  0.980017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1596  RND family efflux transporter MFP subunit  33.93 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2094  RND family efflux transporter MFP subunit  35.67 
 
 		 377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0888739  normal  0.0111779 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  34.71 
 
 		 415 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  34.71 
 
 		 415 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.71 
 
 		 377 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  34.71 
 
 		 415 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2866  HlyD family secretion protein  37.28 
 
 		 576 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2591  RND family efflux transporter MFP subunit  34.32 
 
 		 463 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422822  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  34.71 
 
 		 415 aa  172  7.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3932  multidrug resistance protein mdtA precursor  37.27 
 
 		 473 aa  172  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.416339 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  34.71 
 
 		 415 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  33.94 
 
 		 411 aa  172  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.71 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  34.71 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2702  multidrug efflux system subunit MdtA  33.13 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  34.71 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1309  HlyD family secretion protein  34.22 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1169  RND family efflux transporter MFP subunit  33.8 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1266  secretion protein HlyD  34.53 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.279661  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  34.71 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0572  secretion protein HlyD  34.73 
 
 		 498 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0544292  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2521  secretion protein HlyD  33.43 
 
 		 435 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  34.54 
 
 		 441 aa  170  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2957  secretion protein HlyD  32.85 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0178504  normal  0.933874 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  34.08 
 
 		 401 aa  170  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>