More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1251 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1251  Alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 561 aa  1163    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  40.33 
 
 		 553 aa  395  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  40.26 
 
 		 538 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  38.64 
 
 		 536 aa  389  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  40.18 
 
 		 549 aa  384  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  39.82 
 
 		 545 aa  385  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  39.53 
 
 		 525 aa  379  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  40.24 
 
 		 535 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  37.92 
 
 		 540 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  39.34 
 
 		 543 aa  376  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  41.03 
 
 		 538 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  38.48 
 
 		 532 aa  370  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  40.86 
 
 		 535 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  37.77 
 
 		 533 aa  371  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  40.95 
 
 		 537 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  39.96 
 
 		 540 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  40.49 
 
 		 542 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  39.81 
 
 		 530 aa  363  6e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  38.71 
 
 		 541 aa  362  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  39.05 
 
 		 528 aa  361  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  38.79 
 
 		 529 aa  361  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  38.04 
 
 		 544 aa  359  9e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  37.5 
 
 		 539 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2209  alpha amylase, catalytic region  37.66 
 
 		 540 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  40.28 
 
 		 540 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  37.83 
 
 		 554 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  38.3 
 
 		 541 aa  358  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  38.62 
 
 		 547 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2133  alpha amylase, catalytic region  37.48 
 
 		 540 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  36.83 
 
 		 554 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2311  alpha amylase, catalytic region  36.73 
 
 		 540 aa  355  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.679266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  36.6 
 
 		 554 aa  354  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  36.54 
 
 		 554 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  37.76 
 
 		 574 aa  354  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  36.36 
 
 		 554 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  36.46 
 
 		 554 aa  353  4e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2039  alpha amylase catalytic region  37.48 
 
 		 540 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  38.36 
 
 		 541 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  36.43 
 
 		 554 aa  352  8e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  36.85 
 
 		 540 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2299  alpha amylase catalytic region  37.28 
 
 		 540 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.823743 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4573  hypothetical protein  37.28 
 
 		 540 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2287  alpha amylase catalytic region  37.28 
 
 		 540 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  36.19 
 
 		 554 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  36.19 
 
 		 554 aa  351  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  36.19 
 
 		 554 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  36.19 
 
 		 554 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1788  alpha amylase, catalytic region  38.17 
 
 		 544 aa  351  2e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  38.18 
 
 		 564 aa  350  4e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  36.01 
 
 		 554 aa  349  9e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2086  alpha amylase catalytic region  37.09 
 
 		 540 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  36.75 
 
 		 555 aa  348  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0984  alpha amylase family protein  37.45 
 
 		 538 aa  345  1e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  37.1 
 
 		 546 aa  343  4e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  38.79 
 
 		 448 aa  342  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  36.4 
 
 		 556 aa  341  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3326  alpha amylase catalytic region  36.95 
 
 		 547 aa  342  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  37.82 
 
 		 575 aa  341  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  37.92 
 
 		 586 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  35.03 
 
 		 541 aa  340  5.9999999999999996e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  35.08 
 
 		 562 aa  339  8e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3483  alpha amylase catalytic region  37.28 
 
 		 542 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906486  normal  0.657022 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  36.1 
 
 		 537 aa  338  9.999999999999999e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  35.04 
 
 		 554 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2954  alpha amylase catalytic region  37.15 
 
 		 549 aa  337  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067439 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2028  alpha amylase, catalytic region  36.36 
 
 		 557 aa  336  9e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  35.15 
 
 		 554 aa  335  9e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0601  alpha-glucosidase  35.96 
 
 		 540 aa  335  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.642438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  37.14 
 
 		 568 aa  334  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0295  alpha amylase catalytic region  36.48 
 
 		 551 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  34.28 
 
 		 549 aa  332  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  36.28 
 
 		 556 aa  332  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  34.28 
 
 		 549 aa  332  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  35.05 
 
 		 550 aa  331  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  34.77 
 
 		 568 aa  331  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  35.34 
 
 		 555 aa  331  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  35.44 
 
 		 550 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  35.78 
 
 		 558 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  35.63 
 
 		 547 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  35.85 
 
 		 558 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  35.61 
 
 		 550 aa  326  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  32.98 
 
 		 560 aa  326  7e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  35.06 
 
 		 558 aa  326  8.000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  35.91 
 
 		 552 aa  326  9e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  35.85 
 
 		 558 aa  325  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  35.01 
 
 		 553 aa  325  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  35.8 
 
 		 536 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  37.99 
 
 		 542 aa  324  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  34.22 
 
 		 557 aa  324  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2620  alpha amylase catalytic region  37.53 
 
 		 560 aa  324  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  33.8 
 
 		 559 aa  324  3e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  36.02 
 
 		 582 aa  323  4e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  35.32 
 
 		 550 aa  323  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  35.32 
 
 		 562 aa  323  6e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  36.14 
 
 		 537 aa  322  8e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  35.5 
 
 		 554 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  36.35 
 
 		 558 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  35.6 
 
 		 536 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  35.66 
 
 		 558 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4341  alpha amylase catalytic region  35.7 
 
 		 539 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>