More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0675 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 271 aa  545  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1502  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1477  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3709  regulatory protein TetR  29.41 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4338  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  32.17 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 98 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0548  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2000  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  40.28 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  41.18 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 200 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 		 232 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 210 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  39.32 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 214 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 219 aa  53.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  35.63 
 
 		 230 aa  53.1  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 218 aa  53.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 186 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1913  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 226 aa  52.4  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 219 aa  52  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 205 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 189 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 203 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 227 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  35.97 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0670  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 		 204 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 205 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 218 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  31.11 
 
 		 207 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0891  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 227 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.735718  normal  0.888939 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1531  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 227 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.357864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 197 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 207 aa  50.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 216 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0041  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 206 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 190 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 238 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 219 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 194 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 202 aa  49.7  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 192 aa  49.3  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 210 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 210 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 194 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 194 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 210 aa  49.3  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0578  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 204 aa  49.3  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 194 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 203 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 204 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 207 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  37.25 
 
 		 191 aa  48.9  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 206 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 201 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 189 aa  48.9  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  30.56 
 
 		 220 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 213 aa  48.9  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  52.27 
 
 		 215 aa  48.9  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 210 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 199 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
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NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 202 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
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NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
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NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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