101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2678 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2678  LmbE family protein  100 
 
 		 237 aa  481  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.545275  normal  0.0774255 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0201  hypothetical protein  66.1 
 
 		 239 aa  298  6e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114045  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4022  LmbE family protein  56.78 
 
 		 238 aa  272  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0251604 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38410  uncharacterized LmbE-like protein  49.13 
 
 		 246 aa  228  8e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2092  LmbE family protein  47.28 
 
 		 247 aa  221  7e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4204  hypothetical protein  48.72 
 
 		 245 aa  217  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.786164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1362  LmbE family protein  45.19 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.0409957 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0094  GlcNAc-PI de-N-acetylase family  46.22 
 
 		 245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0093  hypothetical protein  46.22 
 
 		 245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4120  LmbE family protein  46.22 
 
 		 245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31270  LmbE-like protein  46.64 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1612  LmbE family protein  48.7 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3203  LmbE family protein  46.22 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.628918  normal  0.0311865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2028  LmbE family protein  46.22 
 
 		 244 aa  205  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.681353  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2515  hypothetical protein  45.8 
 
 		 258 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0330  LmbE-like protein  45.53 
 
 		 246 aa  201  6e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0698342  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  37.61 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  30.21 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  32.68 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  30.3 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  28.64 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  27.94 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  27.55 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  28.45 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  27.94 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  27.73 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  27.59 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  27.14 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  28.15 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  26.32 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  28.87 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  27.84 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  29.24 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2558  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.15 
 
 		 492 aa  55.5  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  24.75 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  27.16 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  31.12 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1395  LmbE family protein  34.97 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.067563  normal  0.604637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  26.87 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  28.34 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  28.47 
 
 		 288 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  26.24 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  27.75 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  29.85 
 
 		 280 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  31.85 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  25.74 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  27.72 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  26.63 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  26.26 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  27.62 
 
 		 308 aa  50.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  26.47 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  25.24 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  30.26 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  27.36 
 
 		 247 aa  49.3  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  26.13 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  26.13 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  26.13 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  26.13 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  26.13 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  26.13 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  26.13 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  27.97 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  25.63 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  25.63 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  30.64 
 
 		 304 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  26.75 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  26.13 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  25.38 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  25.12 
 
 		 266 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  27.98 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  27.91 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  32.18 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  26.67 
 
 		 358 aa  46.6  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  22.66 
 
 		 245 aa  46.2  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  20.59 
 
 		 223 aa  46.6  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  31.5 
 
 		 230 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  27.23 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  25.64 
 
 		 298 aa  45.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  26.18 
 
 		 233 aa  46.2  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  27.6 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  22.39 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  27.92 
 
 		 359 aa  45.4  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  24.38 
 
 		 225 aa  45.4  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  26.21 
 
 		 243 aa  45.1  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  24.12 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  29.2 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  27.44 
 
 		 283 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  30.41 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  23.16 
 
 		 257 aa  43.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  28.43 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  31.79 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  26.64 
 
 		 286 aa  43.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  23.44 
 
 		 203 aa  42.7  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  30 
 
 		 323 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  27.66 
 
 		 299 aa  42.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  23.98 
 
 		 238 aa  42.4  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  27.13 
 
 		 270 aa  42  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  24.31 
 
 		 288 aa  42  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  29.76 
 
 		 303 aa  42  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  27.14 
 
 		 288 aa  42  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>