More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5808 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5808  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432179  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  38.05 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0726  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0930  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.491637 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6375  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.405237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6608  GntR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0123942 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6206  GntR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00935659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3432  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0695  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3435  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.478263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2049  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 214 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384927  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3093  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.744122 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3448  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 222 aa  89  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 231 aa  86.3  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 227 aa  85.9  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 229 aa  85.9  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 212 aa  84.7  9e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  35.41 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  32.98 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  34.59 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0360  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.200246  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  32.31 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  32.45 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  25.63 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  32.12 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  34.55 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3445  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0532986  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  26.4 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4211  transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.349011  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1921  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 		 265 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3090  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268358  normal  0.787214 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3145  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>