More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0695 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0695  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  470  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6375  GntR family transcriptional regulator  52.42 
 
 		 238 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.405237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6608  GntR family transcriptional regulator  56.04 
 
 		 218 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0123942 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0930  transcriptional regulator, GntR family  47.87 
 
 		 213 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.491637 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6206  GntR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 218 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00935659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  44.98 
 
 		 228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0726  GntR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5808  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432179  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3432  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  34.54 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3435  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 211 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.478263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3448  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3093  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.744122 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0185  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.27943  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2049  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384927  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1526  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.625253  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3649  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 216 aa  72  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0460435 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 212 aa  71.6  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1921  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3552  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.430063  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2317  GntR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0600206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3559  transcriptional regulator, GntR family  34.4 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  32.41 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  30.4 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4523  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  32.04 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  44.66 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  33.56 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  28.83 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  27.32 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  30.09 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1526  transcriptional regulator, GntR family  35.33 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000364413 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6326  putative transcriptional regulator  30.81 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 214 aa  67  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6983  GntR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3445  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0532986  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  29.2 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>