More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3090 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3090  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  410  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268358  normal  0.787214 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3445  GntR family transcriptional regulator  99.53 
 
 		 211 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0532986  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2052  GntR family transcriptional regulator  85.78 
 
 		 211 aa  320  8e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304694  normal  0.140706 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3435  GntR family transcriptional regulator  61.43 
 
 		 211 aa  230  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.478263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0535  GntR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372585 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6553  GntR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697702 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5808  GntR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432179  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3780  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104971 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3432  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  33.14 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  30.66 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  33.96 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  37.68 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.93 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  33.49 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0726  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 255 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 251 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 		 232 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2049  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384927  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 251 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5559  transcriptional regulator GntR family  31.72 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2823  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.346929  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 275 aa  68.6  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2134  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  28.08 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  35.86 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  36.14 
 
 		 265 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 265 aa  68.2  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  31.41 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2539  transcriptional regulator  33.96 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.824223  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  28.08 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>