More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2925 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 286 aa  591  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  78.32 
 
 		 286 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  77.97 
 
 		 286 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  77.19 
 
 		 286 aa  461  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  60.49 
 
 		 286 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  51.28 
 
 		 298 aa  279  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  47.91 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  42.61 
 
 		 284 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  43.35 
 
 		 281 aa  222  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  40.15 
 
 		 282 aa  219  5e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  40.35 
 
 		 327 aa  215  8e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  41.9 
 
 		 286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  39.38 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  41.26 
 
 		 298 aa  203  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  37.88 
 
 		 321 aa  202  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  38.19 
 
 		 367 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  39.65 
 
 		 285 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  43.36 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  40.08 
 
 		 257 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  37.59 
 
 		 261 aa  176  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  36.58 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  37.17 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  37.6 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  34.89 
 
 		 276 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  34.36 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  36.23 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  34.63 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  36.14 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  34.22 
 
 		 271 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  35.4 
 
 		 289 aa  152  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  34.73 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  34.87 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  38.46 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  34.21 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  37.6 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  35.91 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  34.75 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  42.93 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  33.21 
 
 		 276 aa  145  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  34.12 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  31.99 
 
 		 268 aa  142  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  32.14 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  33.46 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  37.91 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  34.75 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  32.69 
 
 		 266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  33.6 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  38.79 
 
 		 269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  33.07 
 
 		 272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  32.83 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  32.85 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  45.16 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  34.14 
 
 		 272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  34.14 
 
 		 272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  34.14 
 
 		 272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  32.81 
 
 		 290 aa  132  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  32.69 
 
 		 310 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  33.58 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  31.58 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  39.53 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  33.72 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  39.63 
 
 		 279 aa  129  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  41.1 
 
 		 268 aa  129  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  37.36 
 
 		 279 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  30.77 
 
 		 294 aa  128  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  37.79 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  34.5 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  31.18 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  38.41 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  31.33 
 
 		 269 aa  125  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  38.89 
 
 		 270 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  38.89 
 
 		 270 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  33.81 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  31.5 
 
 		 267 aa  123  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  35.83 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  40.68 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  30.74 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  35.59 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  31.91 
 
 		 273 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  29.67 
 
 		 275 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  36.09 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  28.94 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  30.34 
 
 		 280 aa  85.5  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  36.28 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  36.28 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  36.28 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  35.33 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  35.34 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  36 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  35.34 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  35.26 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  40.22 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  32.9 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  38.98 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  34.24 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  40.68 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  32.89 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  38.67 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  33.81 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>