More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0414 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0414  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 416 aa  809    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  40.94 
 
 		 440 aa  295  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  40.94 
 
 		 440 aa  295  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  40.45 
 
 		 440 aa  293  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  39.55 
 
 		 446 aa  288  9e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  39.6 
 
 		 440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  40.55 
 
 		 440 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  39.36 
 
 		 445 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  43.27 
 
 		 458 aa  272  9e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  43.36 
 
 		 423 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  43.3 
 
 		 451 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  42.77 
 
 		 453 aa  269  8e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  40.86 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  43.81 
 
 		 440 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  42.48 
 
 		 456 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  42.77 
 
 		 451 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  39.69 
 
 		 447 aa  266  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  40.25 
 
 		 424 aa  266  5.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  43.07 
 
 		 452 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  40.25 
 
 		 424 aa  265  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  39.6 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  41.03 
 
 		 457 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  43.88 
 
 		 444 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  40.51 
 
 		 442 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  39.8 
 
 		 440 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  39.69 
 
 		 440 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  39.02 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  41.33 
 
 		 444 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  42.33 
 
 		 448 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  42.33 
 
 		 448 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  39.64 
 
 		 441 aa  247  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  40.42 
 
 		 471 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  42.64 
 
 		 449 aa  246  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  42.65 
 
 		 445 aa  244  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  41.81 
 
 		 445 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  41.36 
 
 		 449 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  40.06 
 
 		 440 aa  240  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  39.36 
 
 		 461 aa  240  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  41.27 
 
 		 472 aa  238  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  39.58 
 
 		 462 aa  233  6e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  38.96 
 
 		 462 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  40.12 
 
 		 482 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  40.12 
 
 		 482 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  39.77 
 
 		 457 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  40.49 
 
 		 428 aa  226  6e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  40.59 
 
 		 426 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  40.82 
 
 		 432 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  39.18 
 
 		 446 aa  223  7e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  38.66 
 
 		 441 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  39.69 
 
 		 438 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  39.82 
 
 		 439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  38.28 
 
 		 433 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  38.62 
 
 		 478 aa  219  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  39.08 
 
 		 439 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  40.18 
 
 		 456 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  36.31 
 
 		 468 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  34.68 
 
 		 463 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  41.23 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  41.23 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  37.71 
 
 		 428 aa  217  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  36.5 
 
 		 445 aa  216  5e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  36.5 
 
 		 445 aa  216  5e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  41.05 
 
 		 463 aa  216  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  37.28 
 
 		 478 aa  215  9e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  36.89 
 
 		 456 aa  215  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  38.42 
 
 		 468 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  37.28 
 
 		 478 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  38.94 
 
 		 458 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  36.89 
 
 		 456 aa  215  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  39.41 
 
 		 498 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  36.26 
 
 		 476 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  40.37 
 
 		 507 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  34.94 
 
 		 443 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  36.63 
 
 		 478 aa  213  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  38.07 
 
 		 422 aa  212  9e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  37.93 
 
 		 479 aa  212  9e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  37.73 
 
 		 439 aa  211  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  37.36 
 
 		 515 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  37.61 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  36.55 
 
 		 479 aa  210  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  37.36 
 
 		 515 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  37.18 
 
 		 479 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  37.36 
 
 		 515 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  37.36 
 
 		 515 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  37.36 
 
 		 521 aa  209  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  37.07 
 
 		 524 aa  209  9e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  37.07 
 
 		 524 aa  209  9e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  37.07 
 
 		 524 aa  209  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  35.97 
 
 		 443 aa  209  9e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  37.07 
 
 		 524 aa  209  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  37.07 
 
 		 530 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  37.07 
 
 		 530 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  37.17 
 
 		 515 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  37.07 
 
 		 524 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  36.47 
 
 		 445 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  36.99 
 
 		 481 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  36.42 
 
 		 522 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  36.55 
 
 		 526 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  36.78 
 
 		 511 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  36.96 
 
 		 429 aa  207  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>