93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1895 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1895  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  557  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0784  hypothetical protein  47.29 
 
 		 280 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294536  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1896  hypothetical protein  41.88 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1526  hypothetical protein  47.87 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2420  putative MxaS-like protein  43.42 
 
 		 289 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.58376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1824  hypothetical protein  45.39 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3048  hypothetical protein  42.11 
 
 		 291 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3802  putative MxaS-like protein  40.62 
 
 		 296 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4032  putative MxaS-like protein  42.55 
 
 		 287 aa  182  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131735  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3277  hypothetical protein  41.03 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0476  hypothetical protein  42.18 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4627  hypothetical protein  41.76 
 
 		 289 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0516119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4513  hypothetical protein  42.86 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0425654  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0688  hypothetical protein  32.51 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2039  hypothetical protein  36.79 
 
 		 287 aa  155  8e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4145  hypothetical protein  42.12 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.46623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4205  hypothetical protein  42.46 
 
 		 284 aa  152  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1912  hypothetical protein  40.43 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8035  hypothetical protein  42.91 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2998  hypothetical protein  33.69 
 
 		 284 aa  85.9  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0475607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  26.37 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  26.94 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  24.03 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  26.89 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  30 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  29.56 
 
 		 287 aa  75.5  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  30.22 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  23.73 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  34.65 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  27.31 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  26.09 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  25.1 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  27.14 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  27.38 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  25.7 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  26.98 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  27.27 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  29.89 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  24.59 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  30.57 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  30.28 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  32.93 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  30.55 
 
 		 329 aa  68.9  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  22.59 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  24.27 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  21.98 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  30.86 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  31.25 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  30.71 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  31.56 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  29.76 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  25.94 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.23 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  27.46 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  27.53 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  20.3 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  30.95 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  27.89 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  26.58 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  26.12 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  24.62 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  29.32 
 
 		 393 aa  55.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  25.93 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  24.58 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  25.88 
 
 		 287 aa  52.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  27.23 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1748  hypothetical protein  28.5 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  43.01 
 
 		 312 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  24.68 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  28.33 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  29.6 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  27.94 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  29.09 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  28.51 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  29.41 
 
 		 318 aa  46.2  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  36.79 
 
 		 338 aa  46.2  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  24.68 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  27.05 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  29.46 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  29.86 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  29.17 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  31.68 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  31.68 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  35.63 
 
 		 339 aa  43.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  28.1 
 
 		 310 aa  42.7  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  26.34 
 
 		 310 aa  42.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  27.47 
 
 		 331 aa  42.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  28.1 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0915  hypothetical protein  26.94 
 
 		 312 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  28.44 
 
 		 312 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  30.65 
 
 		 311 aa  42.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  25.33 
 
 		 300 aa  42.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  26.32 
 
 		 302 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>