More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1676 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1676  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  431  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0861  OmpA/MotB domain-containing protein  48.33 
 
 		 230 aa  190  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6338  hypothetical protein  34.39 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.258634 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0058  putative lipoprotein  29.8 
 
 		 172 aa  74.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0053  putative lipoprotein  29.8 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6517  hypothetical protein  40.74 
 
 		 143 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4259  hypothetical protein  40.74 
 
 		 143 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00984605 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6620  hypothetical protein  40.74 
 
 		 143 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  40.86 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  38.89 
 
 		 460 aa  62.4  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  37.23 
 
 		 533 aa  62  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  36.75 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  32.56 
 
 		 533 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  36.97 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  35.59 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  39.81 
 
 		 607 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  40.52 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 543 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  36.03 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  36.96 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  36.96 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  26.32 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  40.59 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  40.48 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.71 
 
 		 542 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  37.17 
 
 		 729 aa  55.5  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 544 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  34.51 
 
 		 1026 aa  55.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  27.13 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  34.75 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  39.13 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  38.57 
 
 		 449 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  41.1 
 
 		 264 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  36.89 
 
 		 352 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  39.44 
 
 		 609 aa  53.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 576 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4235  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 347 aa  52.8  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  31.14 
 
 		 261 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1973  OmpA/MotB domain-containing protein  37.68 
 
 		 311 aa  52.8  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  39.6 
 
 		 269 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  34.72 
 
 		 291 aa  52.4  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  37.38 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  33.02 
 
 		 319 aa  52.8  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  35.19 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  30.7 
 
 		 727 aa  52  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  31.9 
 
 		 525 aa  52  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  36.75 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  33.33 
 
 		 241 aa  51.6  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  33.64 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 241 aa  51.6  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  32.69 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0995  OmpA/MotB domain protein  30.71 
 
 		 179 aa  51.6  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0802  OmpA/MotB domain-containing protein  38.37 
 
 		 578 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  36.9 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  42.25 
 
 		 631 aa  51.2  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0730  OmpA domain-containing protein  38.37 
 
 		 578 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  31.37 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  46.38 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  36.9 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  34.26 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  36.9 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  37.68 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  36.9 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  35.64 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0781  OmpA domain-containing protein  35.14 
 
 		 573 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  34.26 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  34.21 
 
 		 420 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  36.78 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  36.04 
 
 		 569 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  34.86 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  37.29 
 
 		 458 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  30.77 
 
 		 268 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  35.53 
 
 		 712 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2507  OmpA domain-containing protein  34.23 
 
 		 578 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  35.4 
 
 		 464 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  40.85 
 
 		 334 aa  50.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  30.3 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  32.04 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  35.85 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  32.2 
 
 		 270 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  28.67 
 
 		 537 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  38.03 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 324 aa  49.7  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  42.25 
 
 		 182 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  31.73 
 
 		 537 aa  49.3  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  34.72 
 
 		 270 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  33.01 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  37.68 
 
 		 1313 aa  49.7  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  35.71 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  34.67 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>