100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0058 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0058  putative lipoprotein  100 
 
 		 172 aa  349  1e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0053  putative lipoprotein  99.42 
 
 		 172 aa  347  7e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6338  hypothetical protein  46.49 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.258634 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1676  hypothetical protein  28.79 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4259  hypothetical protein  32.11 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00984605 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6517  hypothetical protein  32.11 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6620  hypothetical protein  32.11 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  36 
 
 		 673 aa  50.8  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  34.58 
 
 		 344 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  31.93 
 
 		 218 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 226 aa  48.5  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  27.22 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0861  OmpA/MotB domain-containing protein  29.63 
 
 		 230 aa  47.4  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  27.59 
 
 		 374 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  32.67 
 
 		 224 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  32.71 
 
 		 331 aa  47.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  28.71 
 
 		 456 aa  47  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  31.73 
 
 		 222 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  29.63 
 
 		 412 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  31.48 
 
 		 424 aa  46.6  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  27.33 
 
 		 398 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0393  OmpA/MotB domain protein  31.08 
 
 		 399 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  26.35 
 
 		 215 aa  45.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  31.86 
 
 		 558 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  34.09 
 
 		 440 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  33.64 
 
 		 344 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2000  OmpA/MotB domain protein  32.58 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  32.41 
 
 		 537 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  32.63 
 
 		 445 aa  45.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  30.33 
 
 		 215 aa  45.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6672  OmpA/MotB domain-containing protein  30.33 
 
 		 552 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  34.72 
 
 		 221 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  34.72 
 
 		 221 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  34.62 
 
 		 694 aa  45.1  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  35.21 
 
 		 228 aa  44.7  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  32.69 
 
 		 220 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  32.69 
 
 		 220 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  32.69 
 
 		 220 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  32.69 
 
 		 220 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  32.69 
 
 		 220 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 240 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 247 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  32.88 
 
 		 458 aa  44.3  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  32.11 
 
 		 324 aa  44.3  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 236 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  32.38 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 240 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  29.36 
 
 		 375 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  28.97 
 
 		 427 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1803  OmpA/MotB domain protein  27.17 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  29.36 
 
 		 375 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  32.38 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  32.38 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  32.38 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  32.38 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  28.32 
 
 		 558 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  32.38 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0155  OmpA family protein  28.32 
 
 		 558 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0131  OmpA family protein  28.32 
 
 		 542 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  34.74 
 
 		 222 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  32.38 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  32.38 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  32.38 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  29.81 
 
 		 320 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  28.83 
 
 		 510 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  32.05 
 
 		 1987 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  33.8 
 
 		 228 aa  42.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  29.66 
 
 		 227 aa  42.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  30.38 
 
 		 631 aa  42.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  27.1 
 
 		 236 aa  42  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  25.96 
 
 		 248 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  33.8 
 
 		 230 aa  42  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  32.08 
 
 		 261 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  33.8 
 
 		 230 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  32.08 
 
 		 261 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  33.8 
 
 		 230 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  29.91 
 
 		 260 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  35.9 
 
 		 187 aa  41.6  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  33.8 
 
 		 230 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  33.8 
 
 		 230 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  33.8 
 
 		 230 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  33.8 
 
 		 230 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1976  OmpA/MotB domain protein  26 
 
 		 331 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0825703  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  36.84 
 
 		 223 aa  41.2  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  28.92 
 
 		 302 aa  41.2  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  31.82 
 
 		 1755 aa  41.2  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  38.89 
 
 		 222 aa  41.2  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 		 324 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  28.97 
 
 		 260 aa  41.2  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  32.08 
 
 		 209 aa  41.2  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  27.36 
 
 		 364 aa  40.8  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  30.7 
 
 		 641 aa  41.2  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  27 
 
 		 440 aa  41.2  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  27.66 
 
 		 222 aa  40.8  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3029  OmpA/MotB domain-containing protein  27.05 
 
 		 555 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  30.48 
 
 		 220 aa  40.8  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 221 aa  40.8  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  26.61 
 
 		 193 aa  40.8  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  25.64 
 
 		 586 aa  40.8  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  29.33 
 
 		 320 aa  40.8  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>