62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6338 on replicon NC_010509
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010509  Mrad2831_6338  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.258634 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0053  putative lipoprotein  47.03 
 
 
172 aa  155  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0058  putative lipoprotein  46.49 
 
 
172 aa  152  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6517  hypothetical protein  40.37 
 
 
143 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6620  hypothetical protein  40.37 
 
 
143 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4259  hypothetical protein  40.37 
 
 
143 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00984605 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1676  hypothetical protein  33.86 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0861  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 
230 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  30.56 
 
 
239 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  29.51 
 
 
344 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  26.67 
 
 
345 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  30.05 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  31.73 
 
 
352 aa  51.2  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3029  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
555 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  31.13 
 
 
264 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  33.96 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5086  OmpA/MotB domain protein  28.04 
 
 
533 aa  48.9  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0672  OmpA/MotB domain-containing protein  31.68 
 
 
165 aa  48.5  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  28.57 
 
 
407 aa  48.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  31.82 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  31.9 
 
 
187 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  29.2 
 
 
324 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  30.19 
 
 
239 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0995  OmpA/MotB domain protein  27.23 
 
 
179 aa  46.2  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  29.25 
 
 
266 aa  45.1  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2223  OmpA/MotB  30.22 
 
 
186 aa  45.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  32.47 
 
 
230 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  32.47 
 
 
230 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  28.7 
 
 
230 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.87 
 
 
673 aa  44.7  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  28.3 
 
 
224 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  32.43 
 
 
294 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  32.43 
 
 
294 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0155  OmpA family protein  30.08 
 
 
558 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  30.08 
 
 
558 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  29.73 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
537 aa  42.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2645  OmpA/MotB  30.56 
 
 
225 aa  42.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6672  OmpA/MotB domain-containing protein  31.62 
 
 
552 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  37.33 
 
 
229 aa  42.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  29.13 
 
 
576 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  32.08 
 
 
320 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  32.88 
 
 
631 aa  42.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  34.21 
 
 
313 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  34.21 
 
 
317 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0992  OmpA/MotB domain-containing protein  29.13 
 
 
190 aa  42  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  35.44 
 
 
168 aa  42  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  35.44 
 
 
168 aa  42  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0131  OmpA family protein  29.27 
 
 
542 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  35.44 
 
 
168 aa  42  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  26.72 
 
 
903 aa  42  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  29.27 
 
 
558 aa  41.6  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0453  OmpA/MotB domain-containing protein  37.31 
 
 
993 aa  41.6  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.164289  hitchhiker  0.000000000838864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  34.21 
 
 
324 aa  42  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  30.84 
 
 
316 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1976  OmpA/MotB domain protein  27.88 
 
 
331 aa  42  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0825703  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  30.84 
 
 
247 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  27.4 
 
 
694 aa  41.6  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1832  OmpA/MotB  29.09 
 
 
523 aa  41.2  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  29.79 
 
 
424 aa  41.2  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  31.68 
 
 
221 aa  41.2  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2312  OmpA/MotB  30.56 
 
 
225 aa  41.2  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>