More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0394 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0394  putative 1,4-butanediol diacrylate esterase  100 
 
 		 397 aa  805    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1441  putative 1,4-butanediol diacrylate esterase  59.8 
 
 		 395 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00263583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2104  beta-lactamase  54.4 
 
 		 396 aa  441  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3905  beta-lactamase  52.84 
 
 		 397 aa  413  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0089  beta-lactamase  52.62 
 
 		 401 aa  396  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2284  hypothetical protein  52.62 
 
 		 395 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2901  beta-lactamase  47.79 
 
 		 760 aa  363  4e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453349  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3549  beta-lactamase  48.53 
 
 		 400 aa  354  1e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2728  beta-lactamase  46.65 
 
 		 387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.144324 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  42.44 
 
 		 395 aa  318  7e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  42.6 
 
 		 395 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  46.39 
 
 		 389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2556  beta-lactamase  46.11 
 
 		 395 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  40.99 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  41.51 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  40.83 
 
 		 419 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0035  putative beta-lactamase  41.64 
 
 		 397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  38.36 
 
 		 437 aa  269  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3473  beta-lactamase  41.25 
 
 		 392 aa  260  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1072  beta-lactamase  38.14 
 
 		 410 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3462  beta-lactamase  35.66 
 
 		 406 aa  222  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00219099  normal  0.0121501 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88817  1,4-butanediol diacrylate esterase  34.69 
 
 		 418 aa  216  4e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.642668 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44235  predicted protein  30.98 
 
 		 397 aa  200  5e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05422  beta-lactamase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07500)  33.16 
 
 		 415 aa  180  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300599  normal  0.931508 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  30.66 
 
 		 420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  30.17 
 
 		 433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  32.9 
 
 		 414 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  31.98 
 
 		 407 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  32.51 
 
 		 409 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  31.01 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  31.23 
 
 		 420 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  30.43 
 
 		 420 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  30.43 
 
 		 420 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  31.16 
 
 		 420 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  30.81 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  30.64 
 
 		 408 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  31.66 
 
 		 417 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  32.79 
 
 		 411 aa  155  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  30.73 
 
 		 424 aa  155  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  30.58 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  29.53 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  31.78 
 
 		 407 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  33.53 
 
 		 405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  33.53 
 
 		 405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  30.73 
 
 		 422 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  27.89 
 
 		 419 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  30 
 
 		 424 aa  152  8e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  31.51 
 
 		 407 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  30.71 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  32.52 
 
 		 407 aa  149  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  36.43 
 
 		 427 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  30.19 
 
 		 406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  32.4 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  29.62 
 
 		 436 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  29.41 
 
 		 430 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  37.06 
 
 		 401 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  29.92 
 
 		 414 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  27.59 
 
 		 411 aa  143  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  30.51 
 
 		 440 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  32.53 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  30.4 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  29.89 
 
 		 370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  37.85 
 
 		 401 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  30.25 
 
 		 410 aa  139  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  30.81 
 
 		 440 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  30.19 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  29.03 
 
 		 431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  35.27 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  35.27 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  27.27 
 
 		 411 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  35.27 
 
 		 401 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  28.12 
 
 		 426 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  30.43 
 
 		 424 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  30.07 
 
 		 437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  31.56 
 
 		 453 aa  132  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  28.57 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  29.06 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  32.05 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  27.54 
 
 		 427 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  29.97 
 
 		 407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  29.82 
 
 		 425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  30.52 
 
 		 422 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  29.04 
 
 		 409 aa  127  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  30.28 
 
 		 438 aa  126  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  28.1 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  29.83 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  25.72 
 
 		 377 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  29.87 
 
 		 417 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  28.21 
 
 		 613 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  33.66 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  30.19 
 
 		 394 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  30.39 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  28.12 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  28.07 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09049  transesterase (LovD), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00920)  29.81 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  28.39 
 
 		 468 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  30 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  25.7 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  27.97 
 
 		 435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  27.27 
 
 		 438 aa  116  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>