272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2105 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 307 aa  592  1e-168  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  45.24 
 
 		 310 aa  258  9e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  43.61 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  45.36 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  42.57 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  34.46 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  32.36 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  31.33 
 
 		 317 aa  155  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  28.75 
 
 		 361 aa  126  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  29.45 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  33.33 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  27.3 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  29.49 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  29.87 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  28.89 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  26.05 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  31.19 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  28.81 
 
 		 299 aa  97.1  4e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  25.81 
 
 		 325 aa  95.9  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  23.38 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  28.66 
 
 		 317 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  27.87 
 
 		 312 aa  93.2  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  26.39 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  28.81 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  28.47 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  25.87 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  29.35 
 
 		 330 aa  86.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  22.6 
 
 		 306 aa  86.7  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  30.27 
 
 		 302 aa  86.7  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1678  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 300 aa  85.5  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  25.41 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  26.11 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  26.11 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.11 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  24.76 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  26.89 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  26.69 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  25.08 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  26.56 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  25.77 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  26.89 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  29.63 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  25.74 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  26.3 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  26.23 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  29.03 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  25.08 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  25.86 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  27.3 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  28.36 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  27.56 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  27.56 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  26.09 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  27.19 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0830  permease  21.11 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  24.5 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  26.61 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  25.49 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2151  Auxin Efflux Carrier  26.96 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  24.52 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  25.32 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  25.49 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  26.01 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  27.4 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  24.26 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  27.74 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  29.36 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  24.5 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  28.14 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  26.48 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  24.84 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  27.87 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  25.11 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  25 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  25.9 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  24.76 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  28.11 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  26.48 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  24.59 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  26.03 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  24.76 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  28.44 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  27.42 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  23.19 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  26.64 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  22.81 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  28.11 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  27.19 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  23.43 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  27.88 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  28.09 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  25.25 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  27.21 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  25.65 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  25.66 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  25.41 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  25.69 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  23.68 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>