More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1852 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 344 aa  693    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1300  MscS mechanosensitive ion channel  37.17 
 
 		 343 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.987941  hitchhiker  0.00895683 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  35.35 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  28.05 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  26.63 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  25.86 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  32.35 
 
 		 338 aa  112  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  31.94 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  27.15 
 
 		 360 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  26.67 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 361 aa  103  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  31.96 
 
 		 369 aa  102  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  25.84 
 
 		 345 aa  102  7e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  32.85 
 
 		 348 aa  102  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  28.64 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  30.88 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  31.91 
 
 		 624 aa  100  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  26.84 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  29.53 
 
 		 484 aa  100  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  29.81 
 
 		 380 aa  99.8  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  27.62 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  34.9 
 
 		 682 aa  98.6  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  30.39 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  29.2 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  30.03 
 
 		 426 aa  97.4  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2479  MscS Mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 		 383 aa  97.4  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  36.55 
 
 		 431 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  37.24 
 
 		 433 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 358 aa  96.7  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  37.24 
 
 		 433 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  28.02 
 
 		 374 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  33.74 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  27.65 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  33.74 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3360  hypothetical protein  28.76 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4427  MscS Mechanosensitive ion channel  27.19 
 
 		 349 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0238849  normal  0.125106 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2398  MscS mechanosensitive ion channel  28.76 
 
 		 374 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  26.15 
 
 		 414 aa  93.6  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  32.06 
 
 		 299 aa  93.2  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  27.89 
 
 		 408 aa  92.8  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  31.89 
 
 		 528 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  31.89 
 
 		 528 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  27.3 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  32.32 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  30.18 
 
 		 418 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1822  MscS mechanosensitive ion channel  28.09 
 
 		 374 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00396347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  27.43 
 
 		 806 aa  90.9  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  28.79 
 
 		 301 aa  90.9  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  28.39 
 
 		 354 aa  90.5  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  27.1 
 
 		 377 aa  90.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  30.3 
 
 		 547 aa  89.7  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0883  MscS mechanosensitive ion channel  33 
 
 		 380 aa  89.7  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  29.31 
 
 		 376 aa  89.7  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  30.47 
 
 		 352 aa  89.4  8e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  33.73 
 
 		 293 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  26.81 
 
 		 294 aa  89.4  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  31.21 
 
 		 356 aa  89.4  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  31.75 
 
 		 534 aa  89  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  33.67 
 
 		 288 aa  88.6  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  39.83 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  35.04 
 
 		 494 aa  89  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  39.83 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  28.24 
 
 		 874 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1650  MscS mechanosensitive ion channel  32.35 
 
 		 570 aa  89  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  30.54 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.99 
 
 		 479 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  33.14 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  33.14 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  33.14 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  33.14 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  33.14 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  33.14 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  48.28 
 
 		 467 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  29.33 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  28.39 
 
 		 374 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  29.78 
 
 		 569 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  26.04 
 
 		 299 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  32.03 
 
 		 561 aa  87  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1210  MscS mechanosensitive ion channel  31.41 
 
 		 344 aa  86.7  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  25.44 
 
 		 374 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  25.44 
 
 		 374 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3357  MscS Mechanosensitive ion channel  31.33 
 
 		 376 aa  86.3  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  33.06 
 
 		 378 aa  85.9  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0039  hypothetical protein  25.37 
 
 		 291 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0970  small-conductance mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 650 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  28.5 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  35.94 
 
 		 538 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  32.9 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  27.1 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  26.24 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  29.58 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  32.22 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  36.15 
 
 		 533 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  28.44 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1446  MscS mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 648 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.770596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  31.15 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  25.35 
 
 		 685 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  35.04 
 
 		 543 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  30.89 
 
 		 633 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>