More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1103 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 248 aa  501  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 227 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 211 aa  98.6  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 211 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 211 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 211 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 211 aa  96.3  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 212 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  28.57 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  26.15 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  24.45 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  25.24 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 194 aa  57  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 196 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0261  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 198 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3760  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 198 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 191 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  20.57 
 
 		 205 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  24.4 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 307 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 357 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 191 aa  53.9  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1242  transcriptional regulator, TetR-family  30.11 
 
 		 190 aa  52.8  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4340  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 203 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 191 aa  52.8  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 297 aa  52.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 239 aa  52.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 194 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  31.33 
 
 		 205 aa  52  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 269 aa  52  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 236 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 209 aa  52  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  22.93 
 
 		 195 aa  52  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 197 aa  52  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 186 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  21.51 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  40.3 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0016  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.951687  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3816  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0181155  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 206 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 206 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  40.3 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3299  transcriptional regulator, TetR family  23.44 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>