163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0437 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  100 
 
 		 147 aa  288  1e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  73.97 
 
 		 147 aa  221  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  65.31 
 
 		 147 aa  194  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  57.75 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  56.85 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  42.86 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  42.86 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  40 
 
 		 154 aa  101  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  39.37 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  45.19 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  40.16 
 
 		 143 aa  98.6  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  42.06 
 
 		 154 aa  98.2  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  34.62 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  33.85 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  33.08 
 
 		 144 aa  90.5  6e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  33.81 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  31.54 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  36.3 
 
 		 157 aa  85.5  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  39.09 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  32.31 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  34.07 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  35.04 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  31.06 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  32.35 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  36.69 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  32.77 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  27.95 
 
 		 166 aa  67  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  28.37 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  29.57 
 
 		 173 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  29.57 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  29.57 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  28.7 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  28.7 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  36.05 
 
 		 538 aa  53.9  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2910  transcription elongation factor NusA  28.85 
 
 		 538 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  32.08 
 
 		 392 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  28.85 
 
 		 393 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0040  transcription elongation factor NusA  28.43 
 
 		 590 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  28.72 
 
 		 506 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2709  transcription elongation factor NusA  31.52 
 
 		 493 aa  47.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0720  transcription elongation factor NusA  32.97 
 
 		 493 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0992944 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  29.81 
 
 		 495 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4713  transcription elongation factor NusA  31.87 
 
 		 493 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4713  transcription elongation factor NusA  31.87 
 
 		 493 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2068  transcription elongation factor NusA  28.72 
 
 		 523 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.571828 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0202  transcription elongation factor NusA  33 
 
 		 503 aa  45.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.504361  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  30.21 
 
 		 423 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1750  transcription elongation factor NusA  30.21 
 
 		 501 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.844805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3609  transcription elongation factor NusA  31.87 
 
 		 493 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4578  transcription elongation factor NusA  31.87 
 
 		 493 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00867288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0178  transcription elongation factor NusA  33 
 
 		 503 aa  45.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.125443  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2121  transcription elongation factor NusA  29.03 
 
 		 506 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.274581  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  26.47 
 
 		 535 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  26.47 
 
 		 535 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  26.47 
 
 		 534 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42830  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 493 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01302  transcription elongation factor NusA  30.69 
 
 		 495 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.30262  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4491  N utilization substance protein A  31.87 
 
 		 493 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.119546  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4181  transcription elongation factor NusA  31.87 
 
 		 493 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0778  transcription elongation factor NusA  31.87 
 
 		 493 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311397  normal  0.0634223 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1865  transcription elongation factor NusA  29.17 
 
 		 495 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.253606  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  27.66 
 
 		 572 aa  45.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01759  transcription elongation factor NusA  30.43 
 
 		 498 aa  44.3  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.320518  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 535 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf784  transcription elongation factor NusA  32.53 
 
 		 524 aa  44.3  0.0005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0488  transcription elongation factor NusA  28.87 
 
 		 502 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.573333  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1100  NusA antitermination factor  31.65 
 
 		 557 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1160  NusA antitermination factor  31.65 
 
 		 557 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1228  NusA antitermination factor  31.65 
 
 		 557 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 533 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1748  transcription elongation factor NusA  32.61 
 
 		 380 aa  43.9  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0632  transcription termination factor NusA  30.43 
 
 		 495 aa  43.9  0.0007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  30.43 
 
 		 475 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0068  transcription elongation factor NusA  30.85 
 
 		 494 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.272639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  27.66 
 
 		 516 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1694  NusA antitermination factor  29.35 
 
 		 497 aa  43.5  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1468  NusA antitermination factor  29.79 
 
 		 491 aa  42.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0601103  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1006  transcription elongation factor NusA  29.35 
 
 		 499 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.614883  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0073  transcription elongation factor NusA  30.85 
 
 		 494 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.837556  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  26.92 
 
 		 548 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62770  transcription elongation factor NusA  29.67 
 
 		 493 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3731  transcription elongation factor NusA  29.35 
 
 		 495 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00415908  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0960  transcription elongation factor NusA  29.35 
 
 		 499 aa  42.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal  0.179607 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0597  transcription elongation factor NusA  29.35 
 
 		 495 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.023824  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5463  transcription elongation factor NusA  29.67 
 
 		 493 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3597  transcription elongation factor NusA  29.35 
 
 		 495 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000179276  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0262  transcription elongation factor NusA  32.56 
 
 		 366 aa  43.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2816  transcription elongation factor NusA  31.25 
 
 		 503 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3562  transcription elongation factor NusA  29.35 
 
 		 499 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.490076  decreased coverage  0.000000857333 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3992  transcription elongation factor NusA  29.35 
 
 		 495 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000690041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  25.81 
 
 		 492 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2492  transcription elongation factor NusA  29.07 
 
 		 544 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0183695  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1029  transcription elongation factor NusA  28.26 
 
 		 499 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0307152  hitchhiker  0.0000658902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2312  transcription elongation factor NusA  28.21 
 
 		 333 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.0487624 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0584  transcription elongation factor NusA  27.96 
 
 		 509 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3240  transcription elongation factor NusA  28.26 
 
 		 499 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.001866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3418  transcription elongation factor NusA  28.26 
 
 		 499 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000438946  hitchhiker  0.000891299 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1601  transcription elongation factor NusA  28.26 
 
 		 503 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.468238  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3281  transcription elongation factor NusA  28.26 
 
 		 499 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000185934  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0562  transcription elongation factor NusA  28.26 
 
 		 503 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>