More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_0003 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 
374 aa  756    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  38.44 
 
 
365 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.41 
 
 
367 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.36 
 
 
370 aa  222  8e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.13 
 
 
367 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.95 
 
 
370 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  31.15 
 
 
379 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.15 
 
 
379 aa  209  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.15 
 
 
379 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.15 
 
 
379 aa  209  8e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  31.15 
 
 
379 aa  209  9e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  31.15 
 
 
379 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.15 
 
 
379 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.18 
 
 
389 aa  207  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.41 
 
 
378 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.77 
 
 
381 aa  206  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.26 
 
 
366 aa  205  9e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.26 
 
 
366 aa  205  9e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  30.73 
 
 
381 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.99 
 
 
381 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  30.73 
 
 
381 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  31.37 
 
 
366 aa  200  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  30.4 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.85 
 
 
378 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  28.08 
 
 
377 aa  194  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  30.61 
 
 
376 aa  193  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.3 
 
 
377 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.3 
 
 
377 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.16 
 
 
367 aa  187  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.51 
 
 
385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  30 
 
 
385 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  30.53 
 
 
378 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.66 
 
 
372 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  30.6 
 
 
376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.73 
 
 
365 aa  179  5.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.07 
 
 
372 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.92 
 
 
380 aa  176  8e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.91 
 
 
375 aa  176  9e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.47 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  29.21 
 
 
378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.8 
 
 
366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  28.95 
 
 
378 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  29.49 
 
 
385 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  29.71 
 
 
390 aa  173  5e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  27.75 
 
 
376 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  26.96 
 
 
376 aa  169  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.19 
 
 
369 aa  169  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.81 
 
 
374 aa  169  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  29.72 
 
 
388 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0002  DNA-directed DNA polymerase  28.42 
 
 
409 aa  166  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  26.7 
 
 
376 aa  166  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  27.08 
 
 
376 aa  166  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.41 
 
 
387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  29.11 
 
 
393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  26.96 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0616  DNA polymerase III, beta subunit  28.02 
 
 
372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  26.96 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  29.79 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  29.11 
 
 
393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  29.26 
 
 
366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  30.26 
 
 
385 aa  163  6e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  26.96 
 
 
376 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.08 
 
 
370 aa  162  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.26 
 
 
372 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  29.11 
 
 
385 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  26.7 
 
 
376 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25 
 
 
372 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.98 
 
 
375 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.3 
 
 
376 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  26.44 
 
 
376 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  27.97 
 
 
367 aa  161  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  26.18 
 
 
376 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  27.85 
 
 
374 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.72 
 
 
375 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  25.8 
 
 
372 aa  159  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.72 
 
 
375 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  25.46 
 
 
369 aa  158  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000352181 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.9 
 
 
373 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.47 
 
 
372 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.24 
 
 
378 aa  157  4e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  26.36 
 
 
374 aa  155  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  29.56 
 
 
385 aa  155  9e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3235  DNA polymerase III, beta subunit  27.63 
 
 
374 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0867918 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.46 
 
 
396 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.04 
 
 
372 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1278  DNA polymerase III subunit beta  27.44 
 
 
373 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  2.76035e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.12 
 
 
372 aa  152  8e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.474691  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.57 
 
 
372 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.51 
 
 
365 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000590568  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  26.33 
 
 
365 aa  150  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2720  DNA polymerase III, beta subunit  26.91 
 
 
372 aa  150  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1549  DNA polymerase III, beta subunit  25.79 
 
 
374 aa  149  6e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15445  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  29.82 
 
 
386 aa  149  8e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.32 
 
 
398 aa  149  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0231  DNA polymerase III, beta subunit  27.06 
 
 
367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000874025  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0963  DNA polymerase III, beta subunit  27.73 
 
 
362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.245361  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.09 
 
 
397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.87 
 
 
398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  29.56 
 
 
386 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  30.15 
 
 
381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000166783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>