172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6778 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  40.88 
 
 		 1489 aa  942    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  59.67 
 
 		 1463 aa  1560    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  34.79 
 
 		 1423 aa  645    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  80.44 
 
 		 1448 aa  2018    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  59.53 
 
 		 1463 aa  1556    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  41.47 
 
 		 1487 aa  947    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  58.37 
 
 		 1451 aa  1491    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  42.55 
 
 		 1424 aa  932    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  100 
 
 		 1530 aa  2853    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  37.24 
 
 		 1428 aa  650    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  60.96 
 
 		 1441 aa  1579    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1404 aa  405  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  32.45 
 
 		 1869 aa  360  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  28.6 
 
 		 1515 aa  306  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  28.6 
 
 		 1510 aa  305  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  28.41 
 
 		 1578 aa  298  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1538 aa  283  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  35.06 
 
 		 2140 aa  271  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  33.82 
 
 		 2032 aa  266  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  30.26 
 
 		 1500 aa  233  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1550 aa  219  5e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  33.74 
 
 		 1276 aa  201  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  33.64 
 
 		 1276 aa  188  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  34.02 
 
 		 1276 aa  189  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  28 
 
 		 1448 aa  186  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  23.94 
 
 		 1405 aa  184  8.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  33.49 
 
 		 1084 aa  183  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  39.6 
 
 		 1206 aa  171  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1462 aa  170  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  28.52 
 
 		 1395 aa  169  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  31.61 
 
 		 1319 aa  168  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  30.35 
 
 		 1335 aa  149  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1396 aa  147  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  28.92 
 
 		 1501 aa  143  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  26.74 
 
 		 1550 aa  129  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1392 aa  128  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  43.03 
 
 		 1937 aa  124  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1783 aa  119  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1398 aa  112  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  26.81 
 
 		 1270 aa  111  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  31.95 
 
 		 1406 aa  110  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1377 aa  99  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  28.54 
 
 		 1401 aa  96.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  27.88 
 
 		 1243 aa  95.1  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1224 aa  95.1  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1229 aa  90.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  28.43 
 
 		 1304 aa  89.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  28.08 
 
 		 1304 aa  89.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1232 aa  89  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1362 aa  88.6  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1226 aa  88.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1221 aa  87.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1256 aa  87.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1325 aa  87  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  24.97 
 
 		 1184 aa  86.3  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  24.97 
 
 		 1184 aa  86.3  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1221 aa  83.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1262 aa  82  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1223 aa  82  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  28.95 
 
 		 1299 aa  82  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1453 aa  80.9  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1224 aa  80.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1255 aa  79.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  27.83 
 
 		 1505 aa  79.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1308 aa  79.3  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0698  hypothetical protein  29.4 
 
 		 1310 aa  79  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1664 aa  78.6  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  31.08 
 
 		 1434 aa  78.2  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1305 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1206 aa  78.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  28.05 
 
 		 1359 aa  77  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1056 aa  76.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1224 aa  77  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1218 aa  75.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1435 aa  75.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1664 aa  75.5  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1392 aa  75.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  26.98 
 
 		 1485 aa  74.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  22.14 
 
 		 1297 aa  73.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  22.43 
 
 		 1299 aa  73.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1473 aa  72.8  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1443 aa  71.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1449 aa  71.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1226 aa  71.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1385 aa  71.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  25.69 
 
 		 1285 aa  70.5  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  26.71 
 
 		 1443 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  25.72 
 
 		 1304 aa  70.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  28.09 
 
 		 1453 aa  71.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1319 aa  71.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  27.83 
 
 		 1398 aa  70.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1448 aa  69.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  32.37 
 
 		 1402 aa  69.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1310 aa  68.9  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1353 aa  68.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  25.71 
 
 		 1273 aa  67  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1273 aa  67.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  26.71 
 
 		 1485 aa  67.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1265 aa  66.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1344 aa  66.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>