More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2726 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2726  substrate-binding protein  100 
 
 
412 aa  846    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.913587  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2694  putative substrate-binding protein  71.5 
 
 
414 aa  632  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5073  putative substrate-binding protein  57.14 
 
 
410 aa  478  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1674  ABC transporter substrate-binding protein  51.26 
 
 
409 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6432  extracellular ligand-binding receptor  52.12 
 
 
407 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00470186  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0807  extracellular ligand-binding receptor  52.51 
 
 
402 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4022  extracellular ligand-binding receptor  50.12 
 
 
404 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339015  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5530  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  49.14 
 
 
401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460998  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2526  ABC transporter substrate-binding protein  54.66 
 
 
411 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.779779  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1336  extracellular ligand-binding receptor  52.65 
 
 
400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5024  extracellular ligand-binding receptor  51.18 
 
 
400 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.151241  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3757  ABC transporter substrate-binding protein  47.06 
 
 
409 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1578  ABC transporter substrate-binding protein  50.75 
 
 
402 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3279  Extracellular ligand-binding receptor  52.38 
 
 
400 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3119  Extracellular ligand-binding receptor  49.01 
 
 
403 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.741733  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1437  extracellular ligand-binding receptor  49.5 
 
 
401 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.694305 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2930  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  47.72 
 
 
411 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0659  putative substrate-binding protein  50.98 
 
 
412 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1936  extracellular ligand-binding receptor  51.59 
 
 
409 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0141282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3282  Extracellular ligand-binding receptor  50.93 
 
 
408 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0100489  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0057  extracellular ligand-binding receptor  48.03 
 
 
405 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3229  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  52.88 
 
 
412 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2953  ABC transporter substrate-binding protein  51.02 
 
 
408 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137688  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1339  ABC transporter substrate binding protein  51.32 
 
 
412 aa  388  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.358784  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4450  Extracellular ligand-binding receptor  52.38 
 
 
401 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378958  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3348  extracellular ligand-binding receptor  48.14 
 
 
403 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.164921 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4449  Extracellular ligand-binding receptor  50.26 
 
 
416 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29774  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3244  extracellular ligand-binding receptor  51.85 
 
 
401 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114685  normal  0.545433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3779  putative ABC transporter, substrate binding protein  47.63 
 
 
408 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2079  branched chain amino acid transport system substrate binding protein  48.05 
 
 
404 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2999  putative urea/short-chain binding protein of ABC transporter  47.51 
 
 
408 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0873398  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3789  Leu/Ile/Val-binding family protein  48.28 
 
 
409 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.710609 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2450  urea/short-chain binding protein of ABC transporter  46.72 
 
 
408 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.045034  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3615  urea/short-chain binding protein of ABC transporter  47.79 
 
 
404 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.489489  normal  0.574773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6461  Extracellular ligand-binding receptor  46.93 
 
 
402 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3503  putative ABC transporter, substrate binding protein  46.72 
 
 
408 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6250  ABC transporter substrate-binding protein  48.95 
 
 
413 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3199  extracellular ligand-binding receptor  45.74 
 
 
405 aa  362  8e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7057  Extracellular ligand-binding receptor  48.03 
 
 
420 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0709  Leu/Ile/Val-binding family protein  47.51 
 
 
406 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6215  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  46.34 
 
 
403 aa  355  7.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2487  Extracellular ligand-binding receptor  45.22 
 
 
404 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.589907  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2256  extracellular ligand-binding receptor  45.48 
 
 
403 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.777349  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0731  hypothetical protein  46.74 
 
 
405 aa  352  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.183807  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4690  extracellular ligand-binding receptor  46.35 
 
 
397 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3421  ABC transporter substrate-binding protein  45.8 
 
 
406 aa  350  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0074  putative branched chain amino acid periplasmic binding protein of ABC transporter  44.36 
 
 
399 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1790  Leu/Ile/Val-binding family protein  47.77 
 
 
417 aa  350  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2475  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  44.85 
 
 
405 aa  348  7e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6729  Extracellular ligand-binding receptor  44.84 
 
 
401 aa  348  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1194  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  49.21 
 
 
405 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4079  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  48.04 
 
 
405 aa  347  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23084  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2460  putative urea/short-chain binding protein of ABC transporter  47.19 
 
 
407 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.04538  normal  0.187515 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0894  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.32 
 
 
401 aa  345  8e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1402  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid- binding protein  46.03 
 
 
401 aa  345  8.999999999999999e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1298  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  47.66 
 
 
419 aa  344  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5300  putative periplasmic substrate binding protein  45.05 
 
 
397 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.401613  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0953  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  46.05 
 
 
401 aa  343  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3593  putative ABC transporter substrate binding protein  44.91 
 
 
403 aa  344  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.636574 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5823  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  44.58 
 
 
401 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281514  normal  0.102648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0682  putative branched chain amino acid binding protein  43.42 
 
 
395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246685  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2864  putative periplasmic binding ABC transporter protein  44.42 
 
 
401 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4400  putative branched chain amino acid periplasmic binding protein of ABC transporter  44.79 
 
 
397 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5091  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  44.41 
 
 
416 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339692  normal  0.603773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1421  UreA/short-chain binding protein of ABC transporter  43.64 
 
 
403 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1152  UreA/short-chain amide ABC transporter  43.08 
 
 
415 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.471291  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5117  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  47.31 
 
 
404 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3303  amide-urea binding protein  44.2 
 
 
404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0969  UreA/short-chain binding protein of ABC transporter  43.75 
 
 
405 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736695  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1640  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  44.13 
 
 
412 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000640664  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1254  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  43.04 
 
 
427 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3887  ureA/short-chain amide ABC transporter  43.31 
 
 
413 aa  330  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0891482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3023  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  47.89 
 
 
406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8470  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  43.38 
 
 
411 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.481667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4670  putative ABC transporter, substrate-binding protein  42.32 
 
 
403 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0329  putative ABC transport protein substrate-binding component  44.61 
 
 
405 aa  326  5e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.42175  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1377  ABC transporter substrate-binding protein  42.5 
 
 
404 aa  325  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1717  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  42.22 
 
 
399 aa  325  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620152  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3122  Extracellular ligand-binding receptor  41.87 
 
 
419 aa  322  7e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0275  putative ureA/short-chain amide ABC transporter  42.61 
 
 
401 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4932  extracellular ligand-binding receptor  43.6 
 
 
409 aa  317  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3297  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  43.42 
 
 
400 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.300791  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4029  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  43.42 
 
 
400 aa  315  7e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7539  putative ABC transporter (substrate binding protein)  42.75 
 
 
394 aa  314  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0486  substrate-binding protein  42.86 
 
 
401 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1190  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  44.05 
 
 
401 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3292  hypothetical protein  42.37 
 
 
400 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.406168  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4065  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.45 
 
 
398 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0198  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  42.45 
 
 
398 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352006  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3991  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.45 
 
 
398 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2936  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  42.19 
 
 
398 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3375  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.19 
 
 
398 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2465  Extracellular ligand-binding receptor  42.82 
 
 
398 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.357174  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3329  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  42.19 
 
 
398 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1607  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.19 
 
 
392 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2137  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand biinding protein  42.37 
 
 
404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3119  extracellular ligand-binding receptor  42.09 
 
 
398 aa  306  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125075  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0554  ureA/short-chain amide ABC transporter  42.93 
 
 
402 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.930825  normal  0.0786148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0182  extracellular ligand-binding receptor  40.24 
 
 
413 aa  306  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1820  Extracellular ligand-binding receptor  42.63 
 
 
404 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>