More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3666 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3666  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 326 aa  671    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0496532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  31.17 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0253  LysR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0324  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4108  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 312 aa  122  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4139  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3449  regulatory protein, LysR  28.18 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4622  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3957  LysR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3589  LysR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3446  LysR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000932924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3365  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal  0.494502 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1811  transcriptional regulator, LysR family  31.15 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193528  hitchhiker  0.00243987 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0296  transcriptional regulator, LysR family protein  26.61 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.35272  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2222  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.176511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3495  regulatory protein, LysR  25.98 
 
 		 322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.268712  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1724  transcriptional regulator  27.02 
 
 		 304 aa  113  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2005  transcriptional regulator, LysR family  31.05 
 
 		 298 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.140319 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1311  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.20499  normal  0.840284 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3164  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0253  LysR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.88055 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2551  LysR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521467  decreased coverage  0.00635729 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3932  transcriptional regulator  27.24 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00420556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4123  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 313 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000527418  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3500  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 313 aa  109  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0910886  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3040  transcriptional regulator, LysR family  29.01 
 
 		 304 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120446  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1528  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 298 aa  109  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0195  transcriptional regulator, LysR family  32.81 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0195  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2913  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.01 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0160728 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4244  LysR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000170817  hitchhiker  0.00215615 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2696  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4272  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0969  LysR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.233069  normal  0.0392284 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3652  LysR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00455  transcriptional regulator  29.02 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01325  transcriptional regulator, LysR family protein  33.51 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3824  LysR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4556  LysR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0216  transcriptional regulator, LysR family  27.16 
 
 		 313 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000946054  normal  0.293728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3751  LysR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 319 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3805  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 311 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.829403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3949  LysR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 319 aa  105  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2991  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  26.07 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3734  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2744  transcriptional regulator, LysR family  28.48 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.546413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.39 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  27.04 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2834  hypothetical protein  26.07 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3501  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.356591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3445  LysR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000626744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2956  LysR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 329 aa  104  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3422  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4643  LysR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1773  LysR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  32.24 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0214  LysR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000152565  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1659  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 314 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.337839  normal  0.66809 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3640  transcriptional regulator, LysR family  27.67 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2863  LysR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 304 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3940  LysR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 310 aa  103  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2971  HTH-type transcriptional regulator, LysR family  27.59 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2826  transcriptional regulator MexT  26.25 
 
 		 304 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3111  LysR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 319 aa  102  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1036  transcriptional regulator of LysR family protein  28.03 
 
 		 313 aa  102  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1282  LysR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.526163  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2666  LysR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3382  LysR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001991  transcriptional regulator  29.02 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1214  LysR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.134847  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2307  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 302 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.975385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  27.98 
 
 		 323 aa  99.8  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3265  transcriptional regulator, LysR family  26.22 
 
 		 309 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3102  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.32 
 
 		 309 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0451779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2978  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 304 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0300552 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6130  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002079  LysR-family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0017  LysR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6418  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000551  transcriptional regulator  28.76 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00357  transcriptional regulator  30.89 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1383  LysR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2223  LysR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1024  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.849003  normal  0.711621 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3409  LysR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 325 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155989  normal  0.11434 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1447  LysR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 329 aa  97.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000494272  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32410  transcriptional regulator MexT  29.01 
 
 		 304 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0999  LysR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.913515  normal  0.929233 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0978  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024266 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05276  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 313 aa  97.1  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>