224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2355 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 1247 aa  2529    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  35.31 
 
 		 1265 aa  513  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  33.79 
 
 		 1238 aa  514  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  66.97 
 
 		 1155 aa  321  6e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  54.21 
 
 		 1227 aa  319  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  47.75 
 
 		 1083 aa  311  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  53.59 
 
 		 1046 aa  302  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  37.76 
 
 		 1308 aa  303  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  53.47 
 
 		 1046 aa  303  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  53.14 
 
 		 1046 aa  302  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  53.14 
 
 		 1046 aa  302  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  53.14 
 
 		 1046 aa  302  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  64.35 
 
 		 1165 aa  298  6e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  45.92 
 
 		 1234 aa  296  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  51.68 
 
 		 1048 aa  295  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  38.75 
 
 		 1144 aa  295  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  53.82 
 
 		 1042 aa  295  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  47.81 
 
 		 1047 aa  294  7e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  51.68 
 
 		 1047 aa  294  8e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  51.68 
 
 		 1047 aa  294  9e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  51.68 
 
 		 1047 aa  294  9e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  51.68 
 
 		 1048 aa  293  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  51.68 
 
 		 1047 aa  293  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  51.68 
 
 		 1048 aa  293  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  51.68 
 
 		 1047 aa  293  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  62.68 
 
 		 1164 aa  271  7e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  46.22 
 
 		 1227 aa  259  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  31.37 
 
 		 1346 aa  252  4e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  34.38 
 
 		 1227 aa  251  8e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  43.81 
 
 		 1091 aa  238  7e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  35.85 
 
 		 1091 aa  238  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  33.54 
 
 		 1088 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  43.36 
 
 		 1226 aa  235  4.0000000000000004e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  42.13 
 
 		 1232 aa  233  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  33.72 
 
 		 1232 aa  229  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  60.89 
 
 		 1137 aa  228  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  64.85 
 
 		 1229 aa  226  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  64.85 
 
 		 1220 aa  226  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  64.85 
 
 		 1229 aa  226  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  48.9 
 
 		 1227 aa  226  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  43.1 
 
 		 1307 aa  224  6e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  27.46 
 
 		 1230 aa  221  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  41.47 
 
 		 1085 aa  219  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  40.86 
 
 		 1211 aa  184  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  34.23 
 
 		 1219 aa  183  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  39.38 
 
 		 1223 aa  181  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  39.4 
 
 		 1223 aa  180  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  49.74 
 
 		 1211 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  44.29 
 
 		 1303 aa  174  5.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  34.97 
 
 		 1214 aa  174  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  47.71 
 
 		 1214 aa  174  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  24.21 
 
 		 1180 aa  173  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  51.85 
 
 		 1214 aa  168  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  51.85 
 
 		 1214 aa  168  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  46.52 
 
 		 1101 aa  167  8e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  39.14 
 
 		 1224 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  21.63 
 
 		 1108 aa  166  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  52.87 
 
 		 1214 aa  164  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  52.87 
 
 		 1214 aa  164  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  52.2 
 
 		 1213 aa  164  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  43.58 
 
 		 1226 aa  164  8.000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1821  SMC domain protein  38.54 
 
 		 1280 aa  160  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137398  normal  0.989347 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  39.73 
 
 		 1227 aa  160  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4886  SMC domain protein  25.98 
 
 		 1244 aa  156  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110633  normal  0.678618 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0305  SMC domain-containing protein  33.55 
 
 		 1248 aa  154  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0349  SMC domain protein  38.63 
 
 		 1248 aa  152  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0381  SMC domain protein  38.46 
 
 		 1248 aa  152  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  32.61 
 
 		 1182 aa  150  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0433  exonuclease SbcC  52.8 
 
 		 1245 aa  134  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0782061  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  50.36 
 
 		 1009 aa  127  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0467  exonuclease SbcC  52.02 
 
 		 1245 aa  127  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.929503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  28.29 
 
 		 1029 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  27.63 
 
 		 1029 aa  121  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0462  exonuclease SbcC  49.47 
 
 		 1247 aa  121  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.345469  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  28.95 
 
 		 1029 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  29.62 
 
 		 1029 aa  119  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  49.64 
 
 		 1009 aa  118  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  49.64 
 
 		 1009 aa  118  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  31.09 
 
 		 1029 aa  118  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  29.35 
 
 		 1029 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  42 
 
 		 881 aa  117  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  30.67 
 
 		 1029 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  30.77 
 
 		 1029 aa  116  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  30.77 
 
 		 1029 aa  116  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  30.67 
 
 		 1029 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  30.54 
 
 		 995 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  39.26 
 
 		 1291 aa  115  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  28.6 
 
 		 1029 aa  115  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  29.04 
 
 		 906 aa  114  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  48.15 
 
 		 910 aa  114  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  31.73 
 
 		 1018 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  36.7 
 
 		 953 aa  112  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  30.56 
 
 		 1013 aa  112  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  35.63 
 
 		 1018 aa  110  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  41.98 
 
 		 1025 aa  109  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  28.46 
 
 		 1018 aa  109  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  29.37 
 
 		 1018 aa  108  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  39.74 
 
 		 1020 aa  107  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  30.5 
 
 		 1038 aa  107  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  38.38 
 
 		 1018 aa  107  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>