More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1809 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1809  ABC transporter related  100 
 
 		 341 aa  684    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0313  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  44.65 
 
 		 430 aa  255  6e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0992  ABC transporter related  56.46 
 
 		 328 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360926 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  30.79 
 
 		 310 aa  170  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  33.77 
 
 		 309 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  34.48 
 
 		 328 aa  169  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  31.56 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  30.67 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  34.17 
 
 		 328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  35.19 
 
 		 317 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3515  ABC transporter related  32.89 
 
 		 313 aa  159  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  32.89 
 
 		 311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  32.89 
 
 		 321 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  35.68 
 
 		 512 aa  151  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  33.22 
 
 		 360 aa  150  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  35.98 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  31.88 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  31.89 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  29.87 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  37.67 
 
 		 328 aa  146  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  31.68 
 
 		 314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  32.9 
 
 		 312 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  41.18 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  39.49 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  28.85 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  34.55 
 
 		 270 aa  144  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2058  ABC transporter, ATPase subunit  29.12 
 
 		 291 aa  143  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  38.79 
 
 		 313 aa  142  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  39.32 
 
 		 1106 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.07 
 
 		 913 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3121  ABC transporter related protein  42.11 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.0000642962 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  36.02 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  33.54 
 
 		 576 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  38.28 
 
 		 593 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.94 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  38.42 
 
 		 510 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  38.89 
 
 		 588 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  30.87 
 
 		 326 aa  139  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  36.32 
 
 		 322 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  37.24 
 
 		 316 aa  139  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0418  ABC transporter related  41.94 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.987895 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  37.44 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  40.51 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0552  ABC transporter related  40.87 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.652365 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0737  ABC transporter related  39.02 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0135458 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  31.97 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  32.57 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  35.12 
 
 		 303 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  33.8 
 
 		 243 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  31.8 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  30.54 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  32.59 
 
 		 301 aa  137  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  37.61 
 
 		 599 aa  136  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  37.37 
 
 		 314 aa  136  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2246  ABC transporter related  33.56 
 
 		 316 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  34.83 
 
 		 248 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  36.8 
 
 		 578 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  26.75 
 
 		 336 aa  135  7.000000000000001e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02620  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.28 
 
 		 337 aa  135  7.000000000000001e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  31.91 
 
 		 335 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  33.06 
 
 		 303 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  30.94 
 
 		 337 aa  135  8e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  30.51 
 
 		 318 aa  135  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  35.55 
 
 		 303 aa  135  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  39.49 
 
 		 313 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  35.98 
 
 		 691 aa  135  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  33.21 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  30.17 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  32.47 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  36.25 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  36.84 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  38.5 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  33.63 
 
 		 247 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2298  ABC transporter related  33.56 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00283386  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  34.12 
 
 		 236 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  37.25 
 
 		 593 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  34.48 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  35.47 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  32.54 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  38.46 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  37.38 
 
 		 578 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1168  ABC transporter related  35.75 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  36.57 
 
 		 922 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  36.23 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3629  ABC transporter related  31.61 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00141619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  35.32 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4530  ABC transporter related  36.82 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.286786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  33.8 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  35.92 
 
 		 295 aa  134  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  28.76 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  35.6 
 
 		 315 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 1171 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  36.79 
 
 		 579 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  39.27 
 
 		 575 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  38.46 
 
 		 314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  33.58 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  35.78 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  37.56 
 
 		 317 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  35.32 
 
 		 323 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>