More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0313 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0313  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  100 
 
 
430 aa  833    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0100242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0992  ABC transporter related  52.66 
 
 
328 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.360926 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1809  ABC transporter related  44.65 
 
 
341 aa  236  5.0000000000000005e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141679  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  33.12 
 
 
308 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  34.66 
 
 
319 aa  180  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  32.7 
 
 
310 aa  178  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  37 
 
 
328 aa  176  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  35.5 
 
 
314 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  35.38 
 
 
328 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  34.09 
 
 
306 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  36.89 
 
 
316 aa  170  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  36.42 
 
 
309 aa  170  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  33.65 
 
 
311 aa  169  7e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  32.8 
 
 
321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  37.55 
 
 
337 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  33.44 
 
 
337 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3121  ABC transporter related protein  39.74 
 
 
350 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.0000642962 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1671  ABC transporter related  36.89 
 
 
316 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  39.81 
 
 
309 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  28.71 
 
 
338 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  32.37 
 
 
317 aa  156  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0418  ABC transporter related  34.69 
 
 
307 aa  156  7e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.987895 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  38.86 
 
 
244 aa  156  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  30.19 
 
 
337 aa  156  8e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  30.1 
 
 
337 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  33.77 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1021  ABC transporter related  43.33 
 
 
237 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00128788 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  38.86 
 
 
244 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  38.86 
 
 
244 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0276  ABC transporter related protein  41.96 
 
 
344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  33.81 
 
 
338 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0737  ABC transporter related  39.35 
 
 
238 aa  154  4e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0135458 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3515  ABC transporter related  31.95 
 
 
313 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1168  ABC transporter related  33.12 
 
 
335 aa  152  8.999999999999999e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  34.29 
 
 
338 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  33.01 
 
 
360 aa  152  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  37.04 
 
 
299 aa  151  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  33.81 
 
 
338 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  38.86 
 
 
244 aa  151  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  36.97 
 
 
244 aa  150  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  36.32 
 
 
331 aa  149  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  33.65 
 
 
325 aa  149  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0089  ABC transporter related  42.44 
 
 
237 aa  149  8e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  32.15 
 
 
339 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  34.23 
 
 
293 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  32.15 
 
 
339 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  35.9 
 
 
304 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  33.12 
 
 
337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  37.44 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  36.97 
 
 
316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  37.44 
 
 
244 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  37.44 
 
 
244 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  36.02 
 
 
316 aa  146  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  37.44 
 
 
244 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  38.39 
 
 
244 aa  147  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  38.39 
 
 
244 aa  146  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  38.39 
 
 
244 aa  146  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  31.01 
 
 
336 aa  146  6e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  37.44 
 
 
244 aa  146  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  38.39 
 
 
244 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  37.33 
 
 
339 aa  146  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  36.49 
 
 
309 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  37.91 
 
 
244 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  34.91 
 
 
293 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0611  ATPase  35.26 
 
 
337 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  37.39 
 
 
341 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  37.74 
 
 
240 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  30.99 
 
 
308 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0690  ABC transporter related  38.93 
 
 
319 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  33.55 
 
 
314 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  38.19 
 
 
306 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.92 
 
 
323 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  32.7 
 
 
369 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  33.64 
 
 
243 aa  144  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  33.55 
 
 
314 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  30.19 
 
 
241 aa  143  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  36.41 
 
 
318 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  35.07 
 
 
337 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  37.62 
 
 
316 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  37.96 
 
 
304 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  38.89 
 
 
301 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  36.67 
 
 
319 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  38.76 
 
 
322 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  26.77 
 
 
312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  37.04 
 
 
307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  26.13 
 
 
309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  34.29 
 
 
579 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  38.5 
 
 
248 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  35.02 
 
 
310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  35.98 
 
 
314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2298  ABC transporter related  30.9 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00283386  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.49 
 
 
317 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2246  ABC transporter related  30.9 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  32.71 
 
 
243 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  31.75 
 
 
317 aa  141  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.27 
 
 
339 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  38.5 
 
 
248 aa  141  3e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  33.82 
 
 
335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  32.9 
 
 
310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  32.9 
 
 
310 aa  140  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>