More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1790 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
165 aa  332  1e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  75.82 
 
 
153 aa  227  7e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  54.19 
 
 
171 aa  178  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  57.55 
 
 
151 aa  164  5e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  50.33 
 
 
168 aa  149  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  54.68 
 
 
151 aa  148  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
145 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
142 aa  59.3  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
157 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
157 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
148 aa  58.2  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
160 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  24.53 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 
151 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 
149 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  32.29 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  29.52 
 
 
165 aa  55.1  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
143 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  26.81 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 
137 aa  55.1  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
156 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  24.4 
 
 
158 aa  54.3  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
164 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
166 aa  53.9  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 
138 aa  53.9  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
148 aa  53.9  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  26.37 
 
 
220 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  27.84 
 
 
152 aa  53.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
163 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
154 aa  52.4  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2666  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
157 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 
139 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
139 aa  52  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  31.31 
 
 
156 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  26.6 
 
 
159 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 
152 aa  52  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  28.57 
 
 
159 aa  51.6  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
153 aa  51.6  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
162 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
162 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 
146 aa  51.2  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
162 aa  51.2  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  26.19 
 
 
162 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  27.38 
 
 
162 aa  51.2  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  27.38 
 
 
162 aa  51.2  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  27.14 
 
 
147 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  33.33 
 
 
174 aa  50.8  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
162 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
142 aa  50.4  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
180 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
151 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
151 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
151 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  21.7 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  30.3 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>